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微孢子虫是一类广泛分布于自然界专性细胞内寄生的真核原生动物,能感染多种宿主,包括无脊椎动物和脊椎动物,是一类人兽共患性疾病病原。它包括1400多种,分别被划入150多个属,其中至少8个属14种微孢子虫能感染人。20世纪80年代以来,随着AIDS广泛流行,微孢子虫被认为是一种重要的条件性致病菌。微孢子虫可以感染免疫功能缺陷者和免疫功能正常者,免疫力正常的人和动物感染微孢子虫后表现为一过性症状,或呈隐性感染；免疫力低下的病人、免疫功能抑制者、免疫缺陷患者尤其是AIDS患者感染后会引起致死性腹泻,是艾滋病患者的主要致死因素之一。此外,微孢子虫还可引起角膜炎,脑炎,心肌炎、泌尿系统、呼吸系统等疾病。微孢子虫病作为一种新发传染病已引起世界范围的公共卫生问题,被美国国立过敏和传染性疾病研究院列入第二类具有潜在危险的微生物名单。为了解我省部分地区猪、羊毕氏微孢子虫病的流行情况,为微孢子虫病的防治及今后的研究提供参考依据,对我省部分地区的猪、羊群进行了毕氏微孢子虫感染情况调查及分子特征的初步研究。1、为了解我省部分地区猪肠道寄生虫病的感染及危害情况,科学地制定防治计划,合理指导动物肠道寄生虫病的防治工作,于2013年5月——2013年9月对河南省7个地区(郑州金水区、辉县、原阳、漯河召陵区、西华、信阳罗山县、中牟)及四川北川等地采集462份样品,应用卢戈氏碘液染色法、饱和蔗糖溶液漂浮法和麦克马斯计数法等方法对所有样品进行检查,结果285份样品查到不同种寄生虫感染,总感染率为61.93%；共查到球虫、隐孢子虫、贾第虫、鞭虫、圆线虫、蛔虫、结肠小袋纤毛虫、阿米巴等8种(类)肠道寄生虫,其中阿米巴感染率最高,为44.81%；且球虫感染强度在<200-4600,圆线虫的感染强度在<200-600。2、为了解河南省部分地区猪毕氏微孢子虫的感染情况及分子特征,用巢氏PCR技术对462份粪便样品进行检测。结果检出120份阳性样品,感染率为25.97%,基因片段长392bp。不同年龄的猪及不同饲养方式饲喂的猪,微孢子虫感染率都存在差异,不同年龄阶段的感染率顺序为：育肥猪(24.07%)、母猪(21.13%)、保育猪(18.52%)、乳猪(12.90%)、公猪(8.33%)；小专业户感染率(42.15%)高于散养(16.08%)高于规模化(3.13%)。河南省中牟毕氏微孢子虫的感染率最高56.41%。将阳性样品测序、BLAST比对后,得到6个序列,在Genbank下载得到的6个序列,应用ClustalX1.81、Phyloip3.64、DNAstar40等生物信息学软件对12个序列进行比对、同源性分析及构建分子发育进化树,最后显示结果,猪感染五个基因型的毕氏微孢子虫,分别为：F(26.47%)、PigEBITS5(2.94%)、EbpD(2.94%)、Type IV(2.94%、EbpC(E、Peru4、WL13)(61.76%),其中、EbpCType Ⅳ基因型也在人类中发现,有人畜共患的潜在风险,还有一个新的基因型,它与人源性基因型Typeiv关系最近,有一个碱基的差异,同源性为99.7%。3、为了解河南省部分地区羊毕氏微孢子虫的感染情况及分子特征,用巢氏PCR技术对802份粪便样品进行检测。结果检出74份阳性样品,感染率为9.23%,基因片段长392bp。不同饲养方式、不同品种、年龄的羊及不同季节的羊,微孢子虫感染率存在差异,绵羊感染率(6.93%)低于山羊(12.35%)；幼龄羊感染率(10.34%)高于成年羊(7.62%)；7-9月羊感染率(12.84%)高于10-12月羊(4.92%)；放牧羊感染率(13.99%)高于舍饲羊(6.59%)。将阳性样品测序、BLAST比对后,得到6个序列,在Genbank下载得到的6个序列,应用Clustal X1.81.Phyloip3.64.DNAstar4.0等生物信息学软件对12个序列进行比对、同源性分析及构建分子发育进化树,最后显示结果,羊感染五个基因型的毕氏微孢子虫分别为：BEB6(83.8%).EbpC/E/Peru4/WL13(9.46%).D(2.70%).其中EbpC、D基因型也在人类中发现,有人畜共患的潜在风险,此外,发现2种新基因型,一种与基因型BEB6较接近,同源性为94.4%,一种在独立的分支上。本研究首次对河南省部分地区猪、羊的毕氏微孢子虫病流行情况进行了调查,并初步研究了其分子特征,发现感染猪、羊的毕氏微孢子虫与分离人类的3种基因型的毕氏肠微孢子虫同源性高达100%,表明猪源、羊源毕氏肠微孢子虫具有人兽共患风险和重要的公共卫生学意义,同时为今后的相关研究提供了参考依据。