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本论文采用流式细胞仪计数法对我国黄海和东海聚球藻、微微型真核浮游生物、异养细菌在不同海区、不同季节、不同水文情况下的分布特点及影响因素进行了研究,同时采用表面荧光显微镜计数法对胶州湾浮游病毒的分布进行了探讨,不仅可以为我国近海海洋微生物生态学的深入研究提供基础性资料,更重要的是希望能为研究海域生态保护措施的制定提供科学参考。1.构建了通过流式细胞仪FSC信号转换细胞粒径的关系,为海洋微微型浮游生物调查提供了更可靠的生物量估算方法。2.对南黄海微微型浮游生物进行了7个月航次调查发现：聚球藻月平均丰度和生物量范围分别为4.0-54.2×103 cell/ml和0.29-5.76μgC/L；微微型真核浮游生物为1.4-8.0×103 cell/ml和0.30-1.64μgC/L；异养细菌为4.1-8.9×105 cell/ml和8.11-17.69μgC/L；对南黄海微微型浮游生物的年变化进行研究,发现聚球藻和异养细菌的丰度和生物量在春末至秋季最高,冬季和初春偏低,微微型真核浮游生物则是在春季最高,其他季节普遍较低；研究发现聚球藻和异养细菌的丰度与温度呈正相关；黄海冷水团区域内微微型浮游生物分布较少。3.对黄海春季水华过程中微微型浮游生物的变化特点进行研究,结果表明：在所调查的4个水华过程中,异养细菌变化始终与叶绿素a含量保持一致趋势,而聚球藻和微微型真核浮游生物则出现了随水华发生,生物量升高／降低两种相反趋势；导致聚球藻和微微型真核浮游生物在水华期生物量下降的原因可能有：水华浮游植物优势种差异,光照竞争作用,营养盐消耗,浮游病毒的作用等,具体机制有待进一步研究和讨论。4.通过对胶州湾的聚球藻、异养细菌进行了4年连续观测,发现2006年至2009年胶州湾聚球藻的表层丰度范围为257 cell/ml至263.9×103 cell/ml,季节变化趋势为春季<冬季<秋季<夏季；异养细菌表层丰度范围为1.07×104 cell/ml到86.59×105 cell/ml,季节变化趋势为冬季<秋季<春季<夏季；聚球藻和异养细菌的丰度变化都与温度存在极显著相关性,异养细菌丰度变化还与叶绿素a含量存在极显著正相关关系；对胶州湾浮游病毒的丰度和分布特点进行研究,发现2007年6-8月胶州湾的浮游病毒丰度为0.48×107/ml至22.78×107/ml,并且呈现从湾内到湾外递减的趋势,胶州湾浮游病毒丰度与异养细菌、聚球藻丰度和叶绿素a含量均呈正相关。5.通过对长江口及邻近海域3个航次的调查,发现夏季至秋季在长江口及邻近海域聚球藻的丰度平均值约为18.73-41.25×103 cell/ml;微微型真核浮游生物为1.07.6.47×10.cell/ml;异养细菌为3.03.20.30×105 cell/ml;聚球藻的丰度主要受到温度和营养盐的影响；异养细菌丰度则主要受到叶绿素a含量和营养盐的影响；在2006年8月,长江口及邻近海区底层可以观察到大面积的水体缺氧现象,未发现聚球藻和微微型真核浮游生物的丰度和分布与低氧有明显相关；对于异养细菌,在低氧区其丰度也未出现明显变化,水体中异养细菌的呼吸作用对低氧的产生和发展贡献可能较为有限。