南海海域笛鲷属常见种类的RFLP分子标记及应用

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本文使用RFLP(mtDNA酶切)技术分析了南海海域笛鲷属的红鳍笛鲷、紫红笛鲷、勒氏笛鲷和约氏笛鲷四种鱼的种内和种间遗传多样性、种间亲缘关系,构建了四种鱼的酶切物理图谱。 用DNase I、RNase I消化法从红鳍笛鲷、紫红笛鲷、勒氏笛鲷和约氏笛鲷四种鱼的肝组织中提取线粒体DNA。纯化后的mtDNA用识别5、6碱基序列的19种限制性内切酶,即BamHⅠ、BglI、Bgl Ⅱ、EcoR I、EeoR V、Hind Ⅲ、HinfI、HpaI、KpnI、MluI、PstI、PvuⅡ、SalI、SeaI、SmaI、StyI、XbaI和XhoI进行单酶解和双酶解,用凝胶图像分析仪检测,根据各酶切片段的长度,测算出红鳍笛鲷、紫红笛鲷、勒氏笛鲷和约氏笛鲷的mtDNA大小分别为17.36±0.09kb、17.58±0.08kb、17.50±0.18kb和17.56±0.12kb。在红鳍笛鲷共发现四种单倍型,其mtDNA多态度π为0.0029;在紫红笛鲷共发现六种单倍型,其mtDNA多态度π为0.0055:在勒氏笛鲷共发现三种单倍型,其mtDNA多态度兀为0.0012;在约氏笛鲷共发现五种单倍型,其mtDNA多态度π为0.0020。红鳍笛鲷和紫红笛鲷群体间平均mtDNA多态度π为0.1062,净遗传距离P<,net>为0.1020,两群体的分歧时间约为1.15x10<7>~1.90x10<7>年。红鳍笛鲷和勒氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度π为0.1305,净遗传距离P<,net>为0.1285,两群体的分歧时间约为1.04x10<7>~1.71x10<7>年。红鳍笛鲷和约氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度ππ<7>为0.1515,净遗传距离P<,net>为0.1491,两群体的分歧时间约为0.96x10<7>~1.59x10<7>年。紫红笛鲷和勒氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度为0.1303,净遗传距离Pnd为0.1270,两群体的分歧时间约为1.04x10<7>~1.72x10<7>年。紫红笛鲷和约氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度π为0.1195,净遗传距离Pnct为0.1157,两群体的分歧时间约为1.09x10<7>~1.80x10<7>年。勒氏笛鲷和约氏笛鲷群体间平均mtDNA多态度冗为0.1394,净遗传距离P<,net>为0.1378,两群体的分歧时间约为1.00×10<7>~1.65×10<7>年。
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