内蒙能源基地位于干旱——半干旱气候区,年蒸发量远大于年降雨量。由于近年来能源基地资源的开发利用,加速了地下水的短缺,对当地的经济和生态造成了一定的影响。因此了解地下水的赋存情况,对合理规划地下水的开采利用具有很深刻的指导意义。本研究在大量的水文地质相关资料的基础上,通过GMS软件模拟对研究区2000-2006年地下水的三维流场进行模拟。模拟结果表明研究区总补给量为465866.66*104m3/a。总排泄量535356.34*104m3/a ,含水层释放的存储量为69491.55*104m3/a。研究区主要的补给来自降雨补给,补给量为456903.71*104m3/a,占总地下水补给量的98.08%,主要的排泄通道是潜水蒸发,蒸发排泄量为428492.12*104m3/a,占总排泄量的80.04%。,次一级的排泄要素是人工开采及边界排泄,占总排泄量的11.21%。但由于研究区范围较大,利用1000m*1000m的分辨率来剖分研究区网格,所得结果较为粗糙,不能较精细的刻化地下水流场,用来矫正模拟水位的观测孔资料也就显得比较鸡肋。因此就需对研究区刻画的更精细,这就加大了处理器的计算量,对处理器的性能也更高。然而,当今单处理机由于处理器、内存以及数据通道系统上的限制已遇到了无法避免的性能瓶颈。因此本研究采用并行的方法利用多核处理机对三维流动方程求解。在利用串行版的MODFLOW2000源程序自动生成水流方程系数矩阵的基础之上,采用OpenMP应用编程接口对预处理共轭梯度(PCG)迭代法进行并行化求解水流方程。经计算串行环境下的模型模拟的模拟时间为20.705s,而同时在并行环境下模拟运算时间比之快1.05-1.11倍。显然,通过并行程序设计能够很好的解决单处理器的性能瓶颈,并能提高计算的效率。