抗生素糖基转移酶系统发育及催化机理分析

来源 :天津大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:zeroxu001
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
糖基化反应是由糖基转移酶催化完成的,它对于抗生素等生物次级代谢产物发挥其生物活性有着十分重要的影响。在一些有着特殊性质的抗生素糖基转移酶(AGt)的催化下,各种初级代谢中不常见的脱氧糖基被连接到抗生素糖苷配基上,使其能够很好地发挥生物功能。本文对目前收集到的所有AGt氨基酸序列进行全面细致的相似性搜索,并利用邻接法、最大似然法和Bayesian法对GT-1成员进行系统发育分析。构建的系统发育树显示,多烯大环内酯AGt与其它聚酮AGt存在比较明显的进化差异,却更接近一些真核来源的糖基转移酶,结合多种序列分析手段推测其可能是来自真核的水平基因转移的产物。以上结论同时得到了基于结构数据的系统发育分析结果的支持。蛋白三维结构的比对揭示了Gtf-蛋白与MurG蛋白之间存在的进化关联,后者是一种参与细菌细胞壁形成的重要糖基转移酶。根据Gtf-蛋白系统发育分析结果,整个糖肽类抗生素生物合成基因簇之间的进化关系也得到了推测。另一方面,基于以结构比对为基础的氨基酸序列比对结果,本文对多个糖基转移酶中结构同源位点的氨基酸残基的功能进行分析,并对其作用机理进行推测。此外,考虑到聚酮AGt与Gtf-蛋白都是GT-1成员,且这两种抗生素糖苷配基合成模式十分相似的事实,文中提出了AGt与其糖苷配基合成酶之间可能存在进化关联的观点。文中也对非GT-1 AGt进行了简单分类,并对其进化来源进行了探讨,分析结果显示它们的祖先蛋白很可能来自各种初级代谢所需的蛋白。
其他文献
头孢菌素类药物属β-内酰胺类抗生素,该类药物以其杀菌力强、抗菌谱广、对β-内酰胺酶的稳定性高、耐药率低、毒副反应低、临床疗效好等优点,深受广大患者的欢迎。据国外文献
社会转型背景下城市社区形态各异,社区自治面临诸多困难与挑战。居民社区责任和治理意识是社区自治的要义与内在要求,在经济精英型社区的自治实践中,社区责任感和治理意识得
文章通过对湖北省技能型人才的实际调查和深入研究,界定了技能型人才的内涵、特点,分析了技能型人才的成长规律,从企业对技能型人才的需求规格与能力素质要求上提出了符合人
韩国比其他海洋强国较早建立了国家海洋政策。根据《海洋水产发展基本法》,韩国已经制定了《海洋水产发展计划》。该计划作为韩国首个与海洋相关的综合发展计划,起到了与国土
随着信息化的迅猛发展和互联网的快速普及,信息网络正以不可阻挡之势深刻影响着广大人民群众的思想观念、行为方式和生活习惯,使党的群众工作环境发生了前所未有的变化,对领
单音节形容词的“二叠式”(以下简称ED)是形容词的一种构形(如普通话“大大de、圆圆de”),区别于同属形容词构形范畴的“三叠式”(如平南白话“白白白”)。ED是汉语中的一种普遍存在,但并非所
<正>近几年,养老保险关系跨地区转移接续已成为一个社会热点问题。2009年12月22日,国务院第93次常务会议讨论通过《城镇企业职工基本养老保险关系转移接续暂行办
<正>不论是风吹叶落的深秋,还是万物凋零、冰天雪地的数九寒冬,在曙光初露的晨曦,在阳光灿烂的午后,在夕阳西下的傍晚,秦皇岛市各大海水浴场、天然水域,你都能看到冬泳健儿搏
本论文以合成基于咔唑的线型共轭齐聚物为出发点,以构筑具有强的发光性能和良好的热稳定性的功能体系为目的,通过发散/收敛法设计并合成了线型的咔唑共轭齐聚物,并修饰到蒽和
在对国内关于环境生态伦理最新文献资料(2005-2006年)进行分类研究的基础上,发现关于环境生态伦理的内涵尚没有统一的描述,环境生态伦理教育国内研究少,触及实际可行的方案更