水稻纹枯病是广西水稻生产中重要的病害之一，防治该病的主要措施是喷洒井岗霉素。井岗霉素的大量使用，造成病原菌的抗药性，防治效果下降。利用有益微生物防治水稻纹枯病是目前该病防治研究的一个重要方向。本研究对广西水稻内生细菌的多样性进行分析，在此基础上筛选对纹枯病菌有抑制作用的拮抗菌株，结果如下：　　 1、从广西稻区的晚稻68种水稻品种中采集了222个水稻标样，分离出1415株菌株，经形态、生理生化测定和16s rDNA序列分析，这些菌株分属于5个属：芽孢杆菌属（Bacillus）、鞘胺醇单孢菌属（Sphingomonas）、土壤杆菌属（Agrobacterium）、伯克霍尔德氏菌属（Burkholderia）和肠杆菌属（Enterobacter）。其中，芽孢杆菌属（Bacillus）和土壤杆菌属（Agrobacterium）为主要类群。芽孢杆菌属（Bacillus）在不同地区、不同水稻品种、不同的生育时期以及不同器官中的数量都占有绝对优势，为水稻内生细菌的优势类群。　　 2、水稻内生细菌的类群随不同地区而异，如：博优679水稻品种在桂西（百色）种植没有分离出Sphingomonas和Burkholderia，而在桂北（河池）种植分离到了这两种类群。　　 3、水稻内生细菌类群也随不同水稻品种而异，如：在百色采集的标样中，Sphingomonas和Burkholderia存在于特优273、特优253和博优228中，而博优258、博优679和特优998中没有发现这两类细菌。　　 4、水稻内生细菌的类群和数量随水稻植株不同器官而变化。如：种植在广西大学农场的柳沙油202号品种，植株的根部分离到Enterobacte，而叶鞘和叶组织分离不到这一细菌。水稻内生细菌主要类群Bacillus和Agrobacterium在水稻不同器官中的数量，以根组织中含量最高（6.9×103 cfu/mL和8.0×103 cfu/mL），其次是鞘（4.0×103 cfu/mL和6.0×103 cfu/mL）和叶组织（2.3×103 cfu/mL和0）。　　 5、水稻内生细菌类群和数量也随水稻不同生育期而变化。如：种植在广西大学农场的柳沙油202号品种，在孕穗期可分离到Burkholderia，而在其他生育期分离不到这类细菌；水稻内生细菌Bacillus，Agrobacterium，Burkholderia和Enterobacter类群的数量，在苗期到孕穗期逐渐上升，从灌浆期到乳熟期下降。　　 6、从375株水稻内生细菌菌株中筛选出对水稻纹枯病菌有拮抗作用的菌株69株，其中，B1693菌株对水稻纹枯病菌拮抗作用较强。经形态、生理生化测定和16s DNA序列分析，B1693菌株被鉴定为巨大芽孢杆菌（Bacillus megaterium）。该菌株生长最适温度为35℃，最适pH为7.0-8.0，能利用蔗糖、葡萄糖、甘露醇、甜醇、D-果糖和D-木糖等碳源和蛋白胨、酵母浸膏、牛肉浸膏、甘酪素等有机氮，硝酸钾和硫酸铵等氮源。通过对B1693菌株的离体和盆栽防治效果测定，先接拮抗菌后接水稻纹枯病菌的分别为72.8％和13.3％，先接水稻纹枯病菌后接拮抗菌的防治效果分别为25％和12.8％。