番茄MPK1/2和H2O2在BR信号转导、诱导抗逆性中的作用和拟南芥H2A.Z参与DNA去甲基化的研究

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人类活动频繁及温室效应等,使得全球大气候发生了急剧的变化,导致农作物会经常遭到多种逆境胁迫的影响,这个给我国农业的发展和农产品的安全生产带了严峻的挑战,也极大地制约了我国蔬菜产业的可持续发展。因此,通过运用生理生化、环境调控、分子遗传学与表观遗传学等手段解析植物对逆境胁迫的响应机制,增强蔬菜作物对不良环境条件的抗性,对提高蔬菜产量、品质和经济效益,以及建立可持续农业皆具有十分重要的科学和现实意义。本文先以番茄(Solanum lycopersicum)为材料,研究了MPK1/2和H2O2信号在BR信号转导和BR所诱导的抗逆性过程中的作用,并利用病毒诱导的基因沉默技术(VIGS)从遗传学上进一步证明MPK1/2和RBOH1在BR诱导抗性过程中决定性作用,研究了MPK1/2和RBOH1对BR信号转导通路的调控,并初步阐明了BR诱导抗性途径与BR自身信号转导通路之间的关系。又以模式植物拟南芥(Arabidopsis thaliana)为材料,研究了组蛋白变异体H2A.Z介导的DNA去甲基化的调控机制,对组蛋白修饰,基因沉默和DNA甲基化进行了深入的研究,为今后研究表观遗传调控下的逆境基因响应的研究奠定基础。综合在番茄和拟南芥上的实验数据,所得主要结果如下:  1发现了EBR能够诱导番茄MPK1/2的磷酸化  通过不同的EBR浓度实验,发现了EBR可以诱导番茄MPK1/2转录水平的上升及蛋白的活性,其EBR所诱导的H2O2的产生与MPK1/2的活性呈现相关性。通过不同BR处理时间,我们明确了MPK1/2的转录水平,MPK1/2活水平,RBOH1的表达和H2O2的产生量与EBR处理时间的动态关系。  2阐明了番茄RBOH1,MPK1和MPK2基因在EBR诱导的抗高温和氧化胁迫过程中的作用  利用VIGS技术,沉默RBOH1,MPK1,MPK2和共沉默MPK1和MPK2后导致植物的抗逆性降低。沉默RBOH1,MPK2和共沉默MPK1和MPK2后EBR不能诱导番茄对高温和氧化胁迫的抗性,单独沉默MPK1后,EBR仍能够提高番茄对逆境的抵抗性。沉默RBOH1后,对MPK1和MPK2的转录水平无影响但是降低了其蛋白激酶的活力,另一方面,沉默MPK1和MPK2后,会导致RBOH1的转录水平降低,H2O2的产生量降低和MPK1/2的活力降低。这些结果表明,MPK2比MPK1在EBR所诱导的番茄抗逆性起着更重要的作用。RBOH1,MPK1和MPK2参与了番茄逆境响应,EBR诱导的抗性过程中,在H2O2的产生和MPK2激酶的激活的环节中,存在一个正向的反馈调节,来维持细胞质外的H2O2的水平及相关的信号过程。  3研究并发现了BR的受体基因BRI1,BAK1及下游的磷酸化转录因子BZR1在调控番茄生长发育和逆境响应过程中的重要作用  BR结合到位于细胞膜上的受体蛋BRI1上,BRI1与其共受体BAK1结合,启动BRI1磷酸化与去磷酸化,从而快速启动细胞内信号的级联放大,最终“打开”和“关闭”数百个影响植物正常生长的基因。本论文利用VIGS技术,系统研究在番茄BRI1,BAK1和BZR1在控制植物生长发育和逆境响应过程中的作用。研究结果表明,沉默BRI1,BAK1和BZR1基因后,植物生长速率减缓,植株矮小,对高温和氧化胁迫更敏感,且阻碍了EBR所诱导的提高植物光和效率和逆境抗性的效果。  4研究了RBOH1和MPK1/2基因对受BR信号通路调控的BR合成基因的影响;分析了BR信号转导通路与BR由RBOH1-H2O2-MPK2介导的抗性途径的相互关系。  受BR合成途径的调控,外源处理不同浓度的EBR会导致BR的合成基因D WARF和CPD的表达下调。利用基因沉默技术,在pTRV-RBOH1和pTRV-MPK1/2沉默植株,CPD和DWARF基因的表达显著下降,而外源BR不再对其有抑制作用,说明RBOH1和MPK1/2参与并调控了BR的信号转导通路。另一方面,沉默BR的受体BRI1、BAK1和下游转录因子BZR1后,通过对抗性,MPK1/2激酶活性和H2O2,MPK1/2, RBOH1基因表达等分析BR信号传导通路与BR诱导的抗性途径之间的相互关系,结果证明BR是通过BR1和BAK1是诱导H2O2和MPK1/2,BZR1可能介于H2O2与MPK2之间。  5利用35S启动子甲基化的水平控制SUC2基因表达进而控制拟南芥根的长短,图位克隆到拟南芥抗基因沉默因子-ARP4,ARP6和PIE1。  以模式作物拟南芥为材料,通过35S启动子驱动SUC2基因表达,导致拟南芥的根会在含有蔗糖的培养基上变短,通过EMS诱变,筛选根长变长的突变体,进行图位克隆,并且找到到3个与拟南芥中抗基因沉默相关的作用因子。ARP4、ARP6和PIE1相对应的突变体里,ROS1和IDM1的表达没有受到影响,说明可能是之前没有报道的激活DNA去甲基化的调节因子。  6组蛋白变异体H2A.Z在抗基因沉默因子-ARP4,ARP6和PIE1介导的去甲基化过程中的重要作用  通过全基因组甲基化测序,突变体arp4,arp6-1和pie1-1里甲基化水平升高,说明这些基因参与了去甲基化的调控。通过蛋白免疫过沉淀技术,研究了ARP4、ARP6和PIE1这3个基因与组蛋白H2A的变异体H2A.Z的相互关系,结果表明拟南芥ARP4、ARP6、PIE1和H2A.Z蛋白是在一个大的复合体里面执行功能。通过染色质免疫共沉淀技术,研究证明了这个复合体所调控的组蛋白变异体H2A.Z在DNA上的富集与抗基因沉默之间的关联,在arp4,arp6-1和pie1-1突变体里,在35S启动子这位点,H2A.Z的聚集量减少,甲基化升高。后续实验中,我们通过CHIP全基因组测序数据,将分析全基因组范围内H2A.Z的聚集与DNA甲基化的相关性。
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