甲状腺乳头状癌血清代谢组学动态变化相关实验研究

来源 :福建医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qazwsx07555
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目的:分析皮下成瘤甲状腺乳头状癌(Papillary Thyroid Carcinoma,PTC)裸鼠血清代谢组学动态差异,发现甲状腺乳头状癌发生发展过程中的差异代谢物质动态变化特征,探讨甲状腺乳头状癌发生发展过程中代谢标记物以及的相关调控因子。方法:1.将实验裸鼠分成三组:A组为皮下接种甲状腺乳头状癌细胞的裸鼠,分别于14天处死为A1组裸鼠,于28天处死为A2组裸鼠;B组为皮下接种正常甲状腺细胞的裸鼠,分别于14天处死为B1组裸鼠,于28天处死为B2组裸鼠;另设空白对照组为C组,为未进行处理的裸鼠,于第1天处死;构建实验组(A1组和A2组)、对照组(B1组和B2组)、空白对照组(C组)裸鼠模型。处死裸鼠后,取其血清进行核磁共振检测。2.采用瑞士Bruker 500Hz核磁共振波谱仪对裸鼠血清进行分析,并采集图谱。使用Bruker Biospin软件对血清样本进行傅立叶转换,调整相位,校准基线。将所有谱图积分面积在进行归一化处理,将其导入基于R语言分析平台并使ggplot包实现可视化。3.根据代谢差异产物,使用京都基因和基因组百科全书确定PTC相关代谢通路,利用miRWalk平台查找于PTC相关miRNA。结果:1.与空白对照组(C组)相比,实验组(A1组和A2组)及对照组(B1组和B2组)裸鼠血清代谢存在动态差异。实验组中,呈持续升高的代谢产物主要有谷氨酰胺、精氨酸、丙氨酸、胆碱、谷氨酸、苏氨酸等;先下降后升高的有异亮氨酸、牛磺酸、脯氨酸、乳酸等;先升高后下降的有柠檬酸等。对照组中,代谢差异产物主要有苏氨酸、牛磺酸、乳酸、柠檬酸、肌酸、甘油等。2.根据KEGG数据库分析发现甲状腺乳头状癌异常代谢涉及糖酵解和糖异生途径;氨基酸生物合成途径;蛋白质消化吸收等途径;其中缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成途径;及丙氨酸、天门冬氨酸和谷氨酸代谢途径代谢异常尤为突出。3.通过miRWalk数据库分析确定与支链氨基酸生物合成相关的miRNA为477种;与甲状腺乳头状癌相关的miRNA为386种。对两组数据进行对比,发现197种重叠miRNA。进一步查阅相关文献,有49种miRNA与甲状腺乳头状癌发生发展有密切关系。结论:1.甲状腺乳头状癌裸鼠皮下成瘤模型,实验组与对照组之间存在代谢动态差异。2.甲状腺乳头状癌动态变化的异常代谢通路主要涉及糖代谢、氨基酸代谢及蛋白质生物合成代谢分解。3.多种miRNA与甲状腺乳头状癌发生发展密切相关,可作为甲状腺乳头状癌生物诊断的理论依据。并为甲状腺乳头状癌分子靶向治疗提供理论基础。
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