本文利用PCR方法扩增测序得到了云豹（Neofelis nebulosa）线粒体基因组DNA的全序列,序列全长16 844 bp,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因,1个控制区以及1个OLR。基因组碱基组成为A: 5 343 bp （31.7%）, C: 4 441 bp （26.4%）, G: 2 491 bp （14.8%）, T: 4 569 bp （27.1%）。与已报导的其它哺乳动物的线粒体基因组相比,云豹线粒体基因组的基因组成、基因排列顺序没有发生变化。在云豹线粒体基因组中,蛋白质编码基因共11 342 bp（包含终止碱基）,其中有2 251个碱基位点发生变异,占总位点数的19.8%;在所编码的3 792个氨基酸中,仅有256个位点发生变异,占总数的6.75%,说明碱基替换多为同义替换。另外,在蛋白质编码基因中,AT偏向性在密码子的第二位点更加明显,这与大多数哺乳动物第三位点AT偏向性较高明显不同。在tRNA基因中,长度最小者为tRNA^{–Ser（AGY）}（59 bp）,最长者为tRNA^–Asn（73 bp）,与典型的脊椎动物线粒体tRNA基因的长度（59～75 bp）相符;除tRNA^{–Ser （AGY）}为二叶草结构,缺失了“DHU”臂外,其余均为典型的三叶草结构。在控制区中,没有发现RS–2重复序列,暗示了重复序列在线粒体基因组中可能没有重要的生物学功能,同时在控制区的CSB–3区存在4个碱基的变异,远远高于已知的其它猫科动物在此区域的碱基变异数量。另外,与其它区域相比,云豹的控制区不仅没有表现出特别明显的AT偏向性,反而是AT含量最低的区域,这也与大多数物种控制区中AT碱基含量最高明显不同。进一步研究还发现,线粒体蛋白质编码基因的序列长度和碱基使用在哺乳动物间具有较高的保守性,而在其它类群的物种中则常存在较大的变异;哺乳动物线粒体Cyt b基因的终止密码子常为AGA,与其它类群明显不同,与云豹线粒体基因组中其它蛋白质编码基因通常使用的终止密码子也明显不同。另外,本文结合GenBank中已报导的12种食肉目物种的线粒体基因组全序列数据,对食肉目物种进行了系统发生分析,其结果与以前的研究结果相一致。为进一步探讨中国猫科动物（Felidae）的系统发生关系,本文对中国产13种猫科动物的12S rRNA基因（约371 bp）和细胞色素b基因（Cyt b）部分序列（约355 bp）进行了分析,并采用“最大简约法”和“最大似然法”分别构建了分子系统树。分析结果表明:在Cyt b基因序列中,有113个位点存在变异（约为总位点数的31.8%）,高于12S rRNA基因序列的44个变异位点