论文部分内容阅读
本研究对塔里木河胡杨林采集的胡杨树叶中分离的内生潜在新菌种NTA-7T进行形态特征、生理生化特征、化学分类特征、16S rRNA基因序列系统发育分析和分子分类特征相结合的多相分类学鉴定，确定其分类地位。 菌株NTA-7T的16S rRNA基因序列测序结果显示：该菌株亲缘关系最近的菌株是Pontibacter toksunensis ZLD-7T，其16S rRNA基因序列(1491bp)相似性为94.55%。菌株Pontibacter actiniarum KMM6156T,Nibribacter koreensis GSR3061T,Rufibacter tibetensis1351T,Adhaeribacter aquaticus MBRG1.5T作为它的参考模式菌株，它们与菌株NTA-7T的16S rRNA基因序列相似性值分别为92.96%，92.00%，91.99%，91.07%。基于16S rRNA基因序列构建的进化树分析结果表明菌株NTA-7T是新的分类单元。 多相分类学鉴定结果显示：菌株NTA-7T是一株革兰氏阴性菌、好氧、不形成芽孢、无鞭毛、无运动型的短杆状细菌，细胞大小为（0.4-0.7）μm×（1.2-2.6）μm。将菌株NTA-7T接种于0.3×MA海洋培养基上，并在30℃下培养两天后出现粉红色菌落，大小为1.6mm、边缘整齐、圆形、光滑。菌株NTA-7T的生长温度范围6-40℃，最适温度30℃、生长pH范围是6.0-9.0，最适pH值是7-8之间、对NaCI的耐受范围是0-6%，最适NaCI浓度为（w/v）0~1%。能生长的培养基是LB、R2A、MA等。菌株NTA-7T不产Flexirubin-type色素。 菌株NTA-7T的氧化酶活性为阴性，而过氧化氢酶活性为阳性，该菌株能水解淀粉、明胶、酪蛋白，但不能水解纤维素，tween20, tween60, tween80。用API ZYM、API20NE、API20E、API50CH实验条对菌株NTA-7T进行生化与酶活性测试，并将测试结果与模式菌株的实验结果进行详细的比对分析。菌株NTA-7T对青霉素、头孢噻肟、链霉素、氨芐西林、庆大霉素、新霉素、西环素、红霉素、利福平及万古霉素敏感，对卡那霉素、妥布霉素、阿米卡星、氯霉素和强力霉素不敏感。 菌株 NTA-7T主要的全细胞脂肪酸成分是 isoC15:0（31.11%）、C16:1ω5c（13.87%）、Summed feature3（13.00%）、Summed feature4（24.16%）、iso C17:0（2.21%）、isoC17:03-OH（2.15%）。主要的极性脂类型是磷脂酰乙醇胺（phosphatidyl ethanolamine,PE）、糖脂(glycolipid, GL)、含有氨基的未知结构的磷脂（unknown aminolipid,APL）、四种未知结构的类脂L1, L2, L3, L4（four unidentified polarlipids）及一个未知磷脂（one unknown phospholipids,PL）。MK-7是菌株NTA-7T的主要呼吸醌类型，G+CmoL%含量为43.2%。总之，菌株NTA-7T的表观特征、生理生化特征、细胞化学成分特征、分子系统特征及在16S rRNA基因序列系统发育树的分支地位都证明了菌株NTA-7T属于Pontibacter属，是该属的一个新物种，其命名为Pontibacter Tarimenes sp.nov.。在Gen Bank数据库中得到的基因序列注册号为KY814729。