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本文利用已有的微生物基因组全序列信息资源，采用比较基因组学和生物信息学相结合的方法，发掘到S. aureus的新特异性检测标记，在此基础上建立了S.aureus PcR检测技术。其主要内容如下：
利用微生物基因组资源和比较基因组学的研究方法，采用perl编程语言编写了序列格式转化软件、基因组序列分割软件以及自动调用序列比对BLASTN的软件。通过S.aureus种内序列的比对分析，总共获得S. aureus种内保守的序列片段4009个，再将这些种内保守片段与其他微生物基因组序列进行比对分析，剔除其中相同的序列片段，保留下来1371个种间特异性片段，即为S. aureus分子检测标记。
对S.aureus检测标记序列进行基因注释和生物学原理的分析，筛选获得了3个S. aureus分子检测标记，sarA、permease和vicK三个基因序列。通过引物设计和PCR扩增，20株细菌验证表明：sarA、permease不具有金黄色葡萄球菌种的特异性；119株细菌验证表明：vick基因扩增得到预期的289bp特异性片段，显示vicK具有良好的种特异性，是S.aureus分子检测标记。
以vicK基因序列为S.aureus特异性检测标记，经过优化PCR反应体系的众多参数，建立了S.aureus PCR检测方法。该反应体系为：1μl Taq DNAPolymerase(2.5U/μl)，5μl10×PCR Buffer，3μl MgCl<,2>(25 mmol/L)，4μl dNTPMixture(各2.5 mmol/L)，1μl vicKl，1μl vicK2，1μl模板DNA，34μlddH<,2>O；PCR反应参数为：95℃预变性5 min；94℃40s，52℃40 s，72℃1min，共35次循环；最后1次循环后72℃再延伸10min；检测灵敏度为5.5×10<3>拷贝/μl，具有良好的稳定性。