当前知识产权保护已经成为国际贸易中最重要的问题之一，特别是在与知识产权密切相关的高新技术贸易中，知识产权的保护问题尤为重要。随着全球经济重心由货物贸易向高新技术贸易转移，高新技术贸易在中国持续高速增长的经济中也发挥着重要的支撑作用。但是我国的高新技术贸易多是以三资企业为主导的，缺乏自主知识产权和自主品牌竞争力，特别容易在高新技术引进和出口方面发生知识产权的争端。所以，在日益强化的世界知识产权保护环境下，我国应如何采取恰当的知识产权保护制度来促进高新技术贸易的发展，具有重要的理论及现实意义。本文从贸易规模、贸易方式、贸易主体、市场分布等方面分析了我国高新技术贸易发展的现状，提出了我国高新技术贸易发展中存在的知识产权方面的问题。选取我国高新技术贸易额为被解释变量，知识产权保护强度为解释变量，引入了IPP指数，运用计量分析方法对我国知识产权保护水平与高新技术贸易的关系做出了实证分析，得出了知识产权保护与我国高新技术贸易之间存在长期稳定的正相关关系的结论。最后，提出了促进我国高新技术贸易健康发展的知识产权策略，如实施知识产权策略，提升我国高新技术创新能力和贸易竞争力；完善知识产权制度，为高新技术贸易健康发展保驾护航；提高知识产权保护意识，减少高新技术流失；增强创新投入力度，增加高新技术贸易产品供给；加强与跨国公司的技术交流与合作，促进高新技术转移；构建知识产权预警机制，增强应对纠纷和诉讼的能力等。