集约化养殖条件下鱼类营养代谢性疾病频发,如何防治是目前亟待解决的问题。鱼体脂肪过度蓄积和脂肪肝等营养代谢性疾病的病因和发病机制极其复杂,是内部遗传和外部环境共同作用所导致的能量代谢障碍性疾病。现有研究多集中在饲喂方式、食物和药物等外界环境因素上,而遗传基因层面的研究仍有一定的局限。寻找营养代谢性疾病相关基因,研究其生物学功能和作用机理已引起水产养殖学界和业界的关注和重视。高通量测序技术为研究者提供了海量的基因信息,如何有效的挖掘、分析和存储数据并用于疾病的防治显得尤为重要。目前,鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库的开发和利用仍处于研究的初期。据此,本研究选取斑马鱼（Danio rerio）、鲤（Cyprinus carpio）、河鲀（Takifugu rubripes）、大黄鱼（Larimichthys crocea）、尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）及虹鳟（Oncorhynchus mykiss）共6种主养经济鱼类为研究对象,综合利用生物信息学和比较基因组的方法挖掘分析现有数据库及文献报道中的营养代谢相关基因,构建6种鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库,搭建在线网络平台用于存储数据。主要研究结果如下:1、NCBI,Ensembl及KEGG数据库鱼类基因组调研分析在NCBI数据库获取了800种鱼类的基因组信息,发现非洲肺鱼（Protopterus annectens）的基因组最大（40054.3Mb）;明晰了组装到染色体水平的186种鱼类的染色体数目,其中,71种鱼类有24对染色体。在Ensembl数据库下载了20个目78种鱼类的基因组数据,发现鲈形目（Perciformes）的鱼类最多（28种）。在KEGG数据库收集了67种鱼类的营养代谢相关基因。整合三个数据库信息,去除重复基因,明确现有数据库中803个鱼类基因组信息。2、六种鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库的构建首先,在KEGG数据库中,分别获取了斑马鱼、鲤、河鲀、大黄鱼、尼罗罗非鱼及虹鳟基因组中2141、566、1131、1669、1283和1483个营养代谢通路相关基因。然后,以OMIM数据库中人类的疾病基因为数据基础,得到了斑马鱼（789个）、鲤（1386个）、河鲀（672个）、大黄鱼（725个）、尼罗罗非鱼（816个）及虹鳟（1236个）基因组中的疾病相关基因。第三,调研2016年以来2037篇文献,分别收集了6个物种中2310（斑马鱼）、2882（鲤）、1552（河鲀）、1639（大黄鱼）、1741（尼罗罗非鱼）及2688（虹鳟）个与营养代谢性疾病相关的基因。最后,合并KEGG数据库、OMIM数据库和文献报道三种来源的基因,构建分别包含4583（斑马鱼）、6287（鲤）、3290（河鲀）、3548（大黄鱼）、3816（尼罗罗非鱼）及5708（虹鳟）个基因的鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库。功能注释结果表明上述基因主要参与调控氧化磷酸化、MAPK信号通路、甘油磷脂代谢及Fox O信号通路等KEGG代谢通路。3、六种鱼类营养代谢性疾病相关基因的系统生物学比较系统生物学比较发现51.6%以上的基因在六个物种中均保守存在,说明不同鱼类基因组中的营养代谢性疾病基因相对保守。DAVID和GO功能注释结果表明,上述保守基因主要参与氧化磷酸化,甘油磷脂代谢及磷脂酰肌醇代谢等KEGG代谢通路。此外,大黄鱼（LOC113746563）,尼罗罗非鱼（LOC100708749、LOC100694817、LOC109194411和LOC100695187）和虹鳟（LOC110530172、LOC110499938、il4/13a）基因组中共有8个物种特异性基因。初步分析各个物种特异性基因,发现它们在氨基酸代谢及免疫反应等生物学过程中发挥重要作用,可作为营养代谢性疾病治疗的新的候选基因。4、搭建鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库网络平台利用JavaEE、Bootstrap3、MySQL 5.7和Apache-tomcat-8.5.70搭建鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库网络在线平台。该平台是一个免费的基因查询、下载和分析的综合平台,不仅收集了斑马鱼、鲤、河鲀、大黄鱼、尼罗罗非鱼及虹鳟基因组中27232个营养代谢性疾病基因数据,还提供在线检索6个物种各基因功能注释、代谢通路以及在其他5个物种中直系同源物等相关信息的功能。综上所述,本研究以KEGG、OMIM和文献汇报的营养代谢性疾病相关基因为基础,首次构建了斑马鱼、鲤、河鲀、大黄鱼、尼罗罗非鱼及虹鳟的鱼类营养代谢性疾病相关基因数据库网络平台。系统生物学比较发现尽管六种鱼类基因组中的鱼类营养代谢性疾病相关基因高度保守,仍存在8个物种特异性基因,这些基因可作为鱼类营养代谢性疾病的个性化治疗靶点。研究结果可为鱼类营养代谢性疾病的治疗和预防奠定坚实的数据支撑。