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目的:探讨自噬基因Atg16L1基因变异体与自噬功能的关系。
方法:首先，采用生物信息学方法，以基因组DNA序列、cDNA序列和EST数据为依据，搜索Pfam数据库、PSIPRED数据库和PDB数据库等，对Atg16L1变异体进行结构分析并对其进行克隆。第二，采用激光共聚焦显微镜技术观察Atg16L1变异体在细胞内自噬泡、溶酶体和线粒体上的定位情况。第三，采用细胞转染技术，过表达Atg16L1变异体和GFP-LC3，分析LC3的酯化变化，进一步探讨Atg16L1变异体对细胞自噬的影响。
结果:(1)人Atg16L1基因可编码七种剪接变异体，其中野生型Atg16L1基因编码607氨基酸，包含coiled-coil区域和七段WD repeats重复结构域。Swiss-PdbViewer4.0.4软件对其变异体分析指出，Atg16L1剪接变异体的差异主要存在于coiled-coil区域中。本文已获得Atg16L1三种变异体:Atg16L1-1蛋白包含全长607氨基酸，包含coiled-coil区域和七段WD repeats重复结构域;Atg16L1-2蛋白缺失外显子8序列相对应的区域;Atg16L1-3蛋白缺失coiled-coil区域。(2)细胞亚定位结果分析指出，Atg16L1-1与MDC（Monodansylcadaverine，一种自噬示踪剂，简称MDC）追踪的自噬泡共定位阳性点数为28.0±2.58 dots，高于Atg16L1-2(15.75±1.71 dots)和Atg16L1-3(3.75±0.75 dots)(P＜0.001)。Atg16L1-1与溶酶体共定位阳性点数为37.67±1.75dots，高于Atg16L1-2（23.14±2.27 dots）和Atg16L1-3（13.0±1.58 dots）（P＜0.001）。Atg16L1-1和Atg16L1-3均可定位于线粒体，其相应的共定位阳性点数分别为14.33±1.53/cell和7.67±1.53/cell（P＜0.01），Atg16L1-2没有在线粒体上定位。(3)过表达Atg16L1变异体对细胞自噬产生影响。共转染Atg16L1-1变异体和GFP-LC312h后，检测细胞内LC3-Ⅱ平均阳性点数（70.2±2.39 dots）高于Atg16L1-2(59.25±2.22 dots)和Atg16L1-3（48.25±2.22 dots）（P＜0.001）。共转染Atg16L1-1变异体和GFP-LC324h后LC3-Ⅱ平均阳性点数均有不同程度降低，其平均阳性点数分别为19.75±1.53（P＜0.01），23.75±1.50和40±1.00（P＜0.001）。
结论:Atg16L1变异体对细胞自噬产生影响。Atg16L1的coiled-coil区域参与自噬机制。