馒头是我国人民尤其是北方人民的传统主食,在膳食结构中一直占有重要的地位。目前,国内外已有许多关于馒头的研究,但这些研究多局限于馒头的原材料、加工工艺以及配料对馒头品质的影响,对馒头品质分子遗传机理方面的研究几乎是空白。近年来,随着生物统计技术的不断发展和基因组学在植物领域的成功应用,利用自然群体单核苷酸多态性（SNP）标记的全基因组关联分析（GWAS）挖掘作物数量性状基因已成为作物领域研究的热点,这为从分子角度研究影响馒头各品质性状的基因提供新的思路。本实验利用24 355个SNP标记对馒头的主要品质性状（比容、色泽以及质构）进行全基因组分析,旨在深入探究基因对馒头品质性状的影响,为结合分子育种技术培育有良好性状的小麦植株奠定基础。主要研究结果如下:1.对四个环境下小麦粉馒头主要品质的表型变异分析表明:各性状表型变异系数存在差异,内a^*、外a^*、硬度、黏着性、胶著性5个性状的遗传变异系数超过20%,比容、外L^*、外b^*、内L^*、内b^*、弹性和回复性7个性状的遗传变异系数位于10%-20%之间。以上性状遗传变异较为丰富,具有较大的改良潜力。2.运用TASSEL3.0软件分析GLM、GLM_Q和MLM_Q+K三种统计模型的显著关联位点数量与Q-Q plot图中每个SNP位点的P值的实际值和期望值的吻合程度,确定研究所用最优统计模型为MLM_Q+K模型。3.在四个环境下,利用24 355个分布于小麦染色体上的SNP位点对馒头主要品质性状进行性状/标记全基因组关联分析。显著水平下（P<0.001）共得到631个性状/标记（Marker-trait association,MTA）关联位点。其中,极显著和相对稳定关联位点78个,贡献率>10%的位点即主效位点84个,分布于小麦的21条染色体上,且染色体4A、2B、5B、7A、3B和6A分布位点数量约占位点总数的56%。4.本研究共得到40个SNP标记同时与两个及以上性状存在关联的多效性关联位点。位于染色体2D上的位点Kukri_c13329₈00和染色体7A上的wsnp_Ex_c14654₂2713386同时关联性状最多（4个）。