随着当今社会步入知识经济时代,创新,成为促进经济发展的重要推动力量,同国家繁荣、民族富强、人民幸福息息相关。创新能力是国家综合国力的关键竞争因素,科技创新能力的有效提升,能够决定经济发展趋势、优化经济结构、促进经济的可持续性发展。我国各地区在增加对科技资源的投入,吸引优秀创新型人才,激发企业研发积极性,推动科研机构的体制改革,优化高校的科研管理体系,改善科技创新环境等方面都取得了一定的发展成果。但我国整体科技创新能力不强,科技创新水平与创新型国家还存在一定的差距。本文在了解研究背景与意义的基础上,以我国31个省市地区的创新活动作为研究对象,建立了多投入多产出的科技创新绩效评价体系。通过DEA方法对我国31个省市三年的截面数据作出静态分析,分别进行了效率测算,再运用Malmquist指数法对科技创新的面板数据作出动态评价分析。由此发现科技创新绩效存在区域发展不平衡,某些地区绩效水平较低的问题。在DEA模型的基础上,引入了Tobit回归模型,从科研发展程度、地区教育环境、经济实力水平、人力资本结构、政府重视程度五个方面出发,综合对我国科技创新绩效的影响因素进行研究分析。从静态截面数据、动态面板数据、影响因素分析三个方面的研究得出结论。并针对科技创新绩效投入、产出、环境等三个方面,分别提出了优化资源配置体系建设,建立科技投入监督机制;增强科学研究实力水平,推进科技创新成果转化;完善科研管理制度建设,激发科技创新发展活力的对策建议。