建立新型合作医疗制度是中共中央、国务院在新形势下加强农村卫生建设的重大举措，这不仅是我国医疗体制改革的重要部分，也是中央为解决“三农”问题做出的重要决策。毫无疑问，新型农村合作医疗制度直接关系到我国几亿农民的健康和利益，是解决好农村“看病难，看病贵”的一项行之有效的办法。而如何解决上述新型农村合作医疗管理队伍中存在的诸多人力资源管理问题直接关系着新型农村合作医疗的开展，因此，本研究应用人力资源管理模型(6要素理论)对云南省弥渡县进行了案例研究(研究采用了资料调查、集中小组访谈、个人深入访谈等方法)；探讨和分析了新型农村合作医疗中存在的人力资源管理问题，并提出相应的解决措施与建议，旨在为国家决策部门提供科学依据，从而促进农村新型合作医疗制度的健康发展。 研究结果表明：1、在云南省弥渡县这一典型贫困新型农村合作医疗试点县，其合作医疗管理队伍存在突出的人力资源管理问题。2、新型农村合作医疗试点县一级人力资源管理问题表现为体制不顺、与城市同等医疗保障管理制度相比，其人力资源管理问题严重制约了当地新型农村合作医疗工作的持续、深入发展。3、新型农村合作医疗试点乡一级人力资源管理问题表现为现有管理队伍中人力资源人员配置数量缺乏、队伍年龄搭配不合理，缺乏管理经验。4、新型农村合作医疗试点村一级人力资源管理问题表现为从事基层合作医疗管理人员数量缺乏，尚未形成有效的合作医疗工作人员激励机制。5、管理人员缺乏相关培训。基于以上发现，建议：1、应进一步加强对新型农村合作医疗人力资源管理工作重要性的认识与重视。2、理顺县一级合作医疗管理体制，建立层级目标责任制。3、完善乡、村合作医疗管理人员配置，加强乡、村两级培训及管理一体化。4、灵活采用激励机制，促进基层合作医疗管理队伍发展。5、多渠道会聚社会各界非政府组织人力资源力量对新型农村合作医疗工作给予有效的指导和支持、监督，促进合作医疗人力资源发展。