实施应用性本科教育,突破我国传统本科学术型人才的单一培养模式,是高等教育大众化的必然结果,也是高等教育为社会培养高层次应用型人才,服务经济社会发展的必然选择。专业是人才培养的平台,专业建设质量将直接决定人才培养质量。应用型专业建设是发展应用性高等教育,培养高素质应用型人才的核心。研究应用型本科高校专业建设问题具有重要的理论与实践意义。本研究在应用性高等教育基本理论问题分析与专业建设内涵把握的基础上,从专业建设五个基本层面切入,通过实地调查与第一手文件资料收集分析认为,应用型本科院校专业建设中存有应用型专业建设体系不配套,应用型本科专业教育理念偏颇,专业建设师资队力量欠缺、学生参与不足,应用型课程建设学术化倾向,应用型专业建设机制不完善等问题。这些问题如不能得到及时有效的解决,势必影响应用型本科院校的健康发展。针对上述问题进行归因分析的同时,以安徽“行知联盟”高校为个案,通过追溯联盟高校专业建设的轨迹,总结联盟高校应用型专业建设取得的成绩与经验,并以此为借鉴,提出高校内部加强专业内涵建设是根本,完善专业建设机制是保障,建立多方合作的专业评价体系是支持,政府宏观管理是应用型本科高校专业建设的保证四方面的相关策略思考,以期为应用型本科高校更好地进行专业建设提供借鉴。