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水稻Xa7基因是一个具有高抗、广谱持久抗性的抗白叶枯病基因。对水稻抗病基因Xa7展开克隆研究,不仅能够丰富关于植物抗病分子机制相关的理论知识,同时也给与抗病分子育种提供了一个新的抗源。在前期的研究中,本实验室利用镇恢084与成恢448杂交构建群体进行图位克隆,结合对IRBB7和IR24的BAC文库测序将Xa7基因精细定在约120kb区间内。但是由于定位区间内基因组序列与常规水稻存在很大差异,无法利用F2代群体的染色体交换对Xa7进行进一步精细定位。本研究通过对镇恢084进行辐射诱变,在10000个M1株系中,筛选得到3个高度感病突变体。利用PCR对定位区间进行扩增,筛选到一个Xa7定位区间染色体发生大片段缺失的突变体ZM2。遗传分析表明镇恢084与ZM2杂交F1抗病,F2群体抗感分离比为3∶1,感病表型与缺失位点紧密连锁。日本晴与ZM2杂交F1感病,F2群体全部感病。通过对感病突变体基因组的高通量测序比对分析,在Xa7定位区间染色体缺失了大小为106kb片段,与之前定位的120kb有25kb的重叠区,最终将Xa7定为位在25kb的区间内。 通过生物信息学分析,在这25kb区间内发现有2个候选基因在IRBB7中接菌后有表达,因此构建的CRISPR/Cas9载体,对IRBB7中G1和G2这2个候选基因,分别进行转基因敲除,得到4个转基因株系。经分子水平鉴定,以及对阳性株系进行接菌验证,发现4个株系均表现抗病表型。推测我们预测的G1和G2的ORF并非Xa7真正的编码框。因此只有通过转基因功能互补分析,才能克隆a7基因。利用可转基因的TAC载体构建水稻品种IRBB7的TAC文库,用PCR筛选a7基因定位区间的TAC阳性克隆。对其中1个阳性单克隆进行转基因。另外设计覆盖定位区间的引物,对筛选到定位区间的阳性单克隆进行PCR扩增,将得到的片段装载到载体pCAMBIA1300上,构建了覆盖Xa7定位区间的4个亚克隆。目前得到TAC阳性克隆和4个亚克隆的转基因苗,通过鉴定为阳性植株,接下来进行大田抗病性鉴定,从而克隆Xa7基因。