高校的思想政治教育是大学教育系统工程的有机组成部分，在帮助学生树立正确的世界观、人生观、价值观中，培养德、智、体、美、劳全面发展的大学生中有着重要的作用。随着科技的日新月异，学生的思想日益呈现多元化的趋势，思想政治理论课教师在授课过程中也出现一些问题，解决这些问题，提高育人的实效性，专业课教师有必要加入到思想政治理论课教师的队伍中来。本文从教师的职责入手，通过调查问卷将目前高校专业课教学中渗透思想政治教育的情况做了初步了解，研究了专业课教学中渗透思想政治教育存在的问题，并通过对问题的分析，找出原因，提出相应的解决措施。论文选取了湖南省部分高校作为研究的对象，使研究具有一定的客观基础，尽量做到理论联系实际。研究方法上，具体采用了文献法、调查法和比较法等。在分析调查结果的基础上，结合教育学、心理学、社会学、管理学等理论，从专业课教师素质的提高和学校内部机制的完善两大方面，提出完善专业课教学中渗透思想政治教育应该坚持的原则，即理论与实际相结合的原则、身教与言教相结合的原则、以人为本与严格要求相结合的原则、教书与育人相结合的原则、针对性原则等。从提高教师的专业素质和思想理论素质两方面提高专业课教师的整体素质。本文以马克思主义理论为基本依据，从明确领导机制和责任机制、建立考评机制和激励机制、完善约束机制、建立沟通机制等四方面，提出具体的完善措施，为高校专业课教学中渗透思想政治创造良好的环境体制。