雄激素处理前列腺癌细胞系最适mRNA和microRNA内参基因筛选

来源 :云南大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liujunqiang6455314
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
实时定量PCR(RT-qPCR,Real-time quantitative PCR)是一项研究基因表达的强有力技术,其凭借自身的多种优势,被广泛地用于分析基因表达量的变化。但是,要想得到准确的qPCR结果,往往需要选用相对稳定的内参基因进行目标基因的校正和标准化。大量的研究表明,适用于所有样品和条件的理想内参基因并不存在,选取不合适的内参基因进行标准化,可能会导致不正确的定量结果,并做出错误的结论。前列腺癌(PCa,Prostate cancer)是男性生殖系统非常常见的恶性肿瘤,也是西方国家中第二大癌症相关的死亡因素。研究表明,雄激素对前列腺癌的影响巨大,其通过雄激素受体(AR,Androgen receptor)调控包括mRNA和miRNA在内的大量基因的表达,这些基因中甚至包括一些内参基因。因此,寻找到可用于前列腺癌治疗靶点的雄激素调节基因,对了解前列腺癌的发展和进程有非常重要的意义。前列腺癌细胞是开展这些研究很好的体外模型,然而,目前还没有关于雄激素处理前列腺癌细胞系最适内参基因筛选的研究。本研究中,我们以五种前列腺癌细胞系为研究对象,使用不同浓度的双氢睾酮(DHT,Dihydrotestosterone)雄激素进行处理,评估了 10 种 mRNA(18S rRA、ACTB、ALAS1、GAPDH、HPRT1、K-ALPHA-1、RPL13A、SDHA、TBP 和 YWHAZ)和 6 种 npcRNA(miR-16、miR-130b、miR-1225-3p、miR-1228-3p、RNU6-2 和 RNU43)内参基因的稳定性。首先,我们通过Western blot实验验证了 DHT处理对测试样品的影响;然后,通过geNorm、Bestkeeper和NormFinder三种算法对内参基因的稳定性进行分析,并最终得到一个推荐的综合排名。结果显示:在所有前列腺癌细胞系中,TBP/ACTB和miR-16/miR-1228-3p分别是用于mRNA和miRNA分析的最适内参基因组合。当考虑到前列腺癌细胞类型时:在AR+细胞中,YWHAZ/ACTB和miR-16/miR-1228-3p分别是用于mRNA和miRNA分析的最适内参基因组合;在AR-细胞中,TBP/GAPDH和RNU43/RNU6-2分别是用于mRNA和miRNA分析的最适内参基因组合。此外,当使用不同稳定性的内参基因对目标基因PCA3和miR-141进行标准化时,目标基因的表达量因所用内参基因的不同而表现出较大的差异。这提示我们,在使用RT-qPCR技术的基因表达研究中,选用适合的内参基因进行校正和标准化的重要性。本研究是在前列腺癌细胞系中,使用不同浓度的DHT处理下,对内参基因的稳定性进行的首次评估。本研究有助于在前列腺癌细胞系中发现更加准确可靠的雄激素调节基因。
其他文献
随着国民经济的发展和工业技术的进步,人们对于配电网电能质量的要求越来越高。配电网静止同步补偿器(distribution static synchronous compensator,D-STATCOM)作为一种重要的电力技术装置,相比于传统的无功补偿装置,具有响应速度快、体积小、容量大、调节连续、输出特性理想等优点,已成为改善配电网电能质量问题的重要手段。D-STATCOM在进行无功功率补偿的同
第一部分异机局部PET/MR影像融合对于18F-FDG PET/CT在原发性肝癌诊断中的增益价值目的:探讨异机局部PET/MR影像融合对于18F-FDG PET/CT在原发性肝癌诊断中的增益价值。方法:
《欢乐之家》创作于19世纪末20世纪初,正值社会上反犹思潮高涨的时期。犹太主题本该是研究该作品的重要切入点之一,但评论家和学者却鲜少涉及这一方面。此外,基于现有为数不
本文利用ASTER遥感数据,结合普朗斑岩型铜矿蚀变分带特征,对组成蚀变分带的矿物波谱特征进行分析研究。分别采用主成分分析法和分形多重分形理论的S-A法(即能谱-面积法),对普
前列腺癌(Prostate cancer,PCa)是男性癌症死亡的主要原因之一。它具有明显的地理和种族差异,最常见于欧美发达国家和地区。我国前列腺癌的发病率尽管低于欧美国家,但随着老
胃癌是世界上发病率第四高的癌症,每年胃癌会夺走700,000条生命,超过60%的胃癌由幽门螺杆菌感染引发。幽门螺杆菌的病原性有多个来源,其中CagA蛋白对细胞的影响尚未被完全揭
索作为一种优良的结构构件,在结构性能方面,能增加结构侧向刚度、提高极限承载力、增加结构耗能、改善破坏模式等;在实际施工中,索具有自重小、材料多样、施工维修和替换方便
电力行业是国民经济的重要基础产业之一,是社会公用事业的重要组成部分。引进国外电力技术有利于我国电力工业的发展。本翻译报告主要有两部分组成,第一部分是翻译报告,共分
有机硅材料因其具有良好的耐高低温性、耐辐射性、耐氧化和耐气候性等,被广泛应用于电子电器、航天、建筑、化工和交通运输等领域,但是传统的聚硅氧烷热导率较低,力学性能也
纤维素纳米晶体(CNC)是一类重要的一维生物质纳米颗粒,一方面,其表面及体相表现出纤维素晶体结构信息;另一方面,表面大量极性基团的存在,使其在水体系中具有优异的分散性能,