伴随着经济的发展和知识存量的累积，企业逐步由资本密集型、劳动密集型发展模式向知识密集型过渡，技术创新的作用日益增强。作为高科技产业之一的生物制药行业，无论西药制造类或中药制造类，能否研制出有市场价值的新药品，往往决定了一家企业在医药制造市场的竞争地位。然而，在中国市场上，医药制造类企业正经受双重考验：一方面，西药制造类企业缺乏自主创新，产品以仿制国外专利药品为主，可能导致大规模的专利费用支付，甚至引发专利诉讼。另一方面，拥有悠久历史和文化传统的中药制造类企业专利意识尚浅，未能及时把握创新成果，自有的专利未能及时注册，不能形成有效专利保护网。在这种局势下，中国生物制药业企业的技术创新进程和发展战略将何去何从？　　 参考国内外学者的相关研究，笔者选取最直观的一个视角--公司层面的微观行为角度，运用统计分析、实证分析、经济计量等多种方法，力求填补制药业技术创新在微观企业层面的研究空白。笔者从三个方面层层深入，分别研究中国制药行业两类上市公司的专利授权数目、专利数目的影响因素、企业业绩与专利数目的关系。展现了中国生物制药类上市公司的实际专利情况，揭示中国两类生物制药类上市公司专利的行为模式和微观机理，发现了专利授权数目的影响因素和专利对于企业绩效的作用，探讨中国生物制药类企业的专利战略发展方向。　　 研究证明，中国制药业上市公司的专利状况在2000年之后取得了较大进展，但各项专利数目仍显不足，相比跨国制药企业，仍存在较大差距。其中，中药类上市公司的专利状况优于西药类企业，以自有的创新专利为主，西药制造类上市公司的专利多为仿制和改良之产物。目前，R&D经费投入依然是两类上市公司专利产出的主要影响因素，人力资本对技术创新的作用尚未充分发挥。专利绩效方面，中药制造类上市公司的综合业绩优于西药制造类，但两类企业的专利数目多少与公司业绩均缺乏明显的相关关系，中国制药业上市公司专利成果的转化成效不高。研究结果表明：中国制药业上市公司虽是该行业龙头，拥有资金、人力、物力等优势，在面对国内制药业市场逐步开放的趋势时，其发展和壮大仍然面临困境。两类上市公司需要根据自身特殊状况制定相应的专利策略，增加R&D资金投入、培养合格的人力资本、提高自身的技术创新能力、保护创新成果，应对国内市场上跨国企业的专利竞争，为全球化发展奠定坚实的技术基础。