起源于美国的企业孵化器从1987年进入我国以来，经过20多年的发展，已经成为了我国促进高新技术产业化，培育有竞争力企业和企业家的重要载体。为我国的科技创新和经济建设做出了有特色的重要贡献。　　 进入21世纪，随着市场经济的不断完善，在政府部门的引导下，企业孵化器进入了多元化发展的黄金时期。由于企业孵化器在事业机制管理形态下存在诸多不足，使得企业化运作形式得到了多种形式地快速发展，企业化运作也渐成企业孵化器运行模式的主要发展方向，研究企业化运作模式对于当前孵化器的更好地发展具有很强的现实意义。　　 本文研究了企业孵化器的相关概念及分类，美国企业孵化器的发展历程和成功经验，对我国企业孵化器现状进行分析，明确了历史发展阶段和现阶段基本情况，指出了四大特征，并分析了存在的问题。通过对不同投资主体的企业孵化器运行模式的优劣比较，指出企业孵化器企业化运行模式是未来的发展方向，详细分析了孵化器企业运作模式的内在原理，得出在此模式下可以达到政府、孵化器、孵化企业三者核心利益的有效结合，并指出孵化器企业化运作的基本条件：投资主体多元化和赢利模式明确化；必须具备的能力：有效选择能力、孵化培育能力、吸纳人才能力、整合资源能力，为企业孵化器的企业化运作明确思路。最后全面分析江西高技术产业发展公司在高技术孵化器上的企业化运作实践案例，通过解构高技术孵化器具有的企业化运作的基本条件和必备能力和“孵化服务+风险投资+产业园”的运作模式，进一步说明孵化器企业化运作的可行性和有效性。并对高技术孵化器下一步的运作提出建议。