目的：基于脑肾轴理论的指导，通过临床对比试验研究，观察与评价以补肾益髓法为立法依据的益脑补肾方配合康复训练治疗卒中后运动功能障碍的临床效果，为从肾治脑提供客观依据，进一步丰富脑肾轴理论。　　方法：选取符合纳入标准的卒中后运动功能障碍患者72例，随机均分为治疗组与观察组，则每组36例。治疗组为在基础治疗的基础上予康复训练+益脑补肾方加减。对照组为在基础治疗的基础上予康复训练。两组治疗前、后分别采用肢体运动功能（FMA）评分量表、日常生活活动能力（BI）评分量表、神经功能缺损程度（CSS）评分量表，两组治疗后采用中风病疗效评价量表对纳入的卒中后运动功能障碍患者进行观察与评价。　　结果：因各种不可控因素，患者脱落6例，完全完成临床观察的患者共66例，其中治疗组32例，对照组34例。治疗组患者的肢体运动功能、日常生活能力、神经功能的恢复提高均优于对照组；经治疗后，治疗组患者中风病疗效的评价优于对照组。　　结论：益脑补肾方加减治疗卒中后肢体运动障碍有较好的临床疗效，可促进患者神经功能、肢体运动功能的恢复，改善患者的日常生活活动能力，从而提高患者的生活质量。基于脑肾轴理论的指导，运用益脑补肾方加减治疗卒中后肢体运动障碍，通过其补肾生髓健脑的作用，达到了从肾治脑的目的，提示了脑肾轴理论值得临床推广。