鸟王茶转录组测序及其初步分析和应用

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鸟王茶是目前全国罕见的有碑文记载的朝廷贡茶,有着悠久的历史和深厚的文化积淀,为贵州省特有的珍稀品种,其可作为远缘杂交、基因嫁接、基因累加等高科技育种材料,以进行突破性育种,是选育优良茶树品种不可替代的基因源。在茶树起源、演化和分类研究上具有重要的学术价值。同时,茶叶中的各种功能性化合物是茶叶具有营养和健康功效的物质基础,决定了茶叶品质的好坏。茶叶中的功能性化合物来源于茶树基因编码的酶,而茶叶中的酶促反应则是代谢网络的一部分。因此,代谢网络对于茶叶中的决定其品质和等级的物质合成至关重要。研究茶叶中的酶及其催化的代谢反应对于了解茶树内的生化反应、挖掘茶树的功能基因、提升茶叶的品质具有基础性与指导性的重要意义。对此本论文针对贵定鸟王茶在遗传和品质两个方向对其转录组在如下3个方面的工作进行展开:1)对野外采集的贵定鸟王茶树样品进行RNA-SEQ测序;2)依据测序数据,探索了鸟王茶转录组中SSR位点的分布,包括SSR序列的类型及其数量、所占比例等;分析了鸟王茶的SSR位点特征。这对鸟王茶种质资源遗传多样性分析、遗传图谱构建、种质资源的保护和合理利用等具有非常重要的价值;3)通过NCBI批量下载工具Batch Entrez[30,38]和java的jsoup的软件包[60]获取数据库中酶的基因序列和注释信息,构建了相应的酶基因数据库,方便对鸟王茶转录组进行快速注释,为鸟王茶代谢网络重构做好前期工作。
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