【摘 要】
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本研究利用生物信息学拼接软件Velvet和Codoncode Aligner对草菇V23-8线粒体基因组的测序reads数据进行了组装拼接。组装结果得到五个片段,分别为contig4, contig5v, conti3,
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本研究利用生物信息学拼接软件Velvet和Codoncode Aligner对草菇V23-8线粒体基因组的测序reads数据进行了组装拼接。组装结果得到五个片段,分别为contig4, contig5v, conti3, contig2, contig1,后又利用Primer Premier5.0软件设计四对引物L11-1,L12-1,L13,L14对草菇V23-8的mtDNA进行PCR扩增、测序、验证后,将五条片段进行连接得到一条长度为约65Kb的片段。选取了24个不同草菇菌株进行了初步的研究。根据线粒体基因组拼接序列白行设计17对非编码区引物,利用设计的引物对提取的24株草菇mtDNA进行PCR扩增检测,将图形资料转换成数据资料后,运用DPS软件采用Jaccard聚类距离中的类平均法(UPGMA)进行0-1数据系统聚类分析,得到系统聚类图。结果显示24个草菇菌株间的相异系数范围在0-0.83之间,在D=0.55的相异系数水平上,24个草菇菌株可以分为7类,其中包括4个复合类群和3个单独类别。从而确立了这种mtDNA分子标记和形态学分类、DNA分子标记相结合来鉴定草菇菌株遗传距离远近的鉴别方法,由线粒体基因组多态性结果选取两个亲缘关系较远的菌株,其单孢配对接触融合后,细胞核向双亲菌落双向迁移。在不同部位取菌块,提取mtDNA并进行验证,得到一对核DNA相同、而mtDNA不同的杂交种。对这两个杂交种菌株出菇,通过测量农艺性状指标(菌丝浓密度、现蕾天数、蛋形期菌柄性状、产量)等几个方面,初步研究由线粒体基因控制性状表达上的不同。
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