创新对一个国家获得可持续的竞争优势来说至关重要,要想获得创新产出必不可少的需要大量的研发投入。企业是社会研发投入的主力军,影响企业研发投入的因素有很多,本文着重关注政府补助和经营环境因素,研究它们与企业研发投入的关系。本文在理论上分析了经营环境、政府补助与研发投入三者之间密不可分的关系。实证部分选取了2010-2012年沪深A股上市公司中的科学研究和技术服务业、制造业、信息传输、软件和信息技术服务业类公司的数据,共2622个研究样本,采用非线性的门槛回归模型,实证研究了经营环境和政府补助对公司研发投入的影响。研究发现:(1)良好的经营环境有利于企业研发投入的增加,并且非国企研发投入受经营环境的影响要大于国企;(2)政府补助对企业研发投入的影响会随着经营环境的变化而变化,呈现出以经营环境为门槛变量的非线性门槛效应;(3)该门槛效应在国企和非国企之间存在一些差异。对国企而言,随着经营环境指数由低到高变化,政府补助对研发投入的作用从最初有显著的促进作用变为无显著的影响;对非国企而言,随着经营环境指数由低到高变化,政府补助对研发投入的影响会由开始的负向作用到正向作用,再到最后无显著作用。针对研究结论,本文提出要使政府补助对企业研发投入的杠杆效应最大化,各地政府应根据企业所处地区的经营环境状况及企业的所有权性质,制定不同的补助政策。