COL3A1及其相关分子作为人类尤文氏肉瘤发展的潜在生物标志物

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目的尤文氏肉瘤(Ewing’s sarcoma,ES)是儿童和青少年第二大最常见的原发性恶性骨肿瘤。MicroRNAs(miRNAs)和mRNAs在调节肿瘤转移中起着重要作用,有望成为尤文氏肉瘤诊断的生物标志物。本研究旨在建立一个基于miRNA和mRNA的尤文氏肉瘤发生发展的预测模型,以提高预测的准确性。方法从基因表达综合数据库(GEO)下载编号为GSE80201和GSE39262的芯片数据。使用生物信息学分析下载和处理数据。利用R软件筛选共同差异表达的microRNAs(DEMs)和基因(DEGs)。利用Funrich数据库进行细胞成分(CC)、分子功能(MF)和生物过程(BP)富集分析。利用Cytoscape和ClueGO进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,构建 mRNA-microRNA 网络。采用Kaplan-Meier Plotter对我们选择的基因表达水平与ES患者总生存期(OS)之间的预后进行分析。根据TCGA数据库进行单因素分析和多因素分析,研究鉴定的miRNA及其靶基因在ES中的表达对预后的价值。结果通过生物信息学分析,鉴定出10个差异表达的miRNA和5个靶向mRNA。KM-plotter软件显示,COL1A2、COL3A1、TGFBI与ES患者的生存率显著相关。高表达的COL3A1 mRNA与ES的远处转移、边缘状态和较差的总生存率相关。此外,多因素分析显示COL3A1是ES患者的独立危险因素。结论综上所述,通过系统的生物信息学分析,我们的研究结果表明COL3A1及其相关分子可能是ES患者潜在的诊断和预后标志物。
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