基于小RNA测序数据识别和分析与阿尔兹海默症有潜在关联的microRNA编辑和突变

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动物microRNA是一类长约22nt、参与调控基因表达的非编码小分子,通过与靶基因的非翻译区碱基互补配对结合,mi RNA可以通过切割降解或者翻译抑制来阻止靶基因发挥生理功能。脑组织中的mi RNA含量丰富,并且有些是脑组织所特有,对神经系统的发育以及突触可塑性的形成起着重要的作用。RNA编辑是指RNA分子在生成过程中受到一些蛋白质的修饰,从而发生核苷酸的改变、删除或插入。核苷酸改变可能会导致microRNA前体的发卡结构发生改变,进而改变成熟microRNA的表达量;或者使成熟microRNA的序列,特别是seed区域,发生改变从而影响microRNA识别正确的靶基因。阿尔茨海默病(AD)是一种起病隐匿的进行性发展的神经系统退行性疾病。在大脑中由于RNA编辑而影响microRNA表达量或许是阿尔兹海默的诱因之一。本课题通过高通量测序技术,即小RNA测序技术,在NCBI中寻找了24个阿尔兹海默症患者的大脑测序数据以及86个正常人类的大脑测序数据。利用实验室开发的Jsmall RNA生物信息学集成分析工具包,对这些数据进行了全面分析。识别出2450个具有显著编辑水平的编辑事件,其中56个A-to-I(G)事件,24个C-to-U事件,57个SNP事件,在阿尔兹海默患者中突变概率显著上调的有340个事件,显著下调的有176个事件。预测了5个microRNA编辑后的靶基因,发现与三个已有研究的基因列表有交集,有很大可能性是靶标。这些研究结果为后面研究RNA编辑在阿尔兹海默症中的影响提供了一些基础。
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