进入21世纪以来,科技资源作为科学技术的基本要素,已经成为国家战略资源；国与国之间的竞争,也逐渐从一般资源配置竞争上升到了科技资源配置的竞争。不断加大对科技资源的投入,已经成为世界各国的战略选择。当前,我国正处于工业化转型的关键时期,科技体制的深层次矛盾在改革进程中同益显露,突出地表现在：国家宏观科技管理体制政出多门、管理部门各自为政,权力高度分散和过分集中的双重矛盾并存；科技项目名目繁多,产学研联系不紧,科技资源配置缺乏整体布局；科技政策法规的效力等级较低,统筹协调力较弱等；科技资源配置主体权责不明,科技资源投入结构不合理,配置与使用效率低下。鉴此,本研究在对我国科技管理政策进行系统回顾和总结的基础上,通过对科技财力和人力资源配置格局的认识和配置效率评价,进一步认识我国科技资源配置现状及变动规律,查找存在的问题,并在借鉴国外经验的基础上,提出针对性的政策建议。论文包括六个部分：一是运用资源配置、新制度经济学、产权和公共选择等相关理论和分析方法,对科技资源及其配置的基本概念和研究范畴进行了界定,构建了科技资源配置研究的理论分析框架；二是在基本概念界定和理论分析的基础上,着重对我国科技管理体制、配置机制和政策体系进行系统的梳理和评价；三是基于相关统计数据,运用集中度测算指数,对我国科技财力资源和人力资源配置的总量、区域及部门等布局情况进行分析；四是通过科技投入产出比率分析和构建“科技投入产出多元回归模型”,对我国科技资源投入产出的绩效进行系统评估；五是运用数据包络分析方法(DEA)中的Malmquist指数对1999-2007年全国和30个省(自治区、直辖市)科技资源配置和研发投入中的全要素生产率指数(TFPch)及其分解指标进行测算,多层次、多角度地对我国科技资源配置效率及其影响因素进行深度剖析；六是在总结发达国家科技资源配置主要做法及经验的基础上,研究提出优化科技资源配置的政策建议。研究表明,虽然我国目前设立了国家科技教育领导小组,在一定程度上使过去政府科技政策或计划决策分散、各自为政的矛盾有所缓解,但并没有从根本上解决我国科技管理体制的平行式组织架构和混合型资源配置模式所导致的资源配置结构不合理、使用效率低下、科技政策难以有效落实等问题。其次,我国财政科技投入存在非常明显的地区差异和不均衡性,主要体现在：国家财政科技投入主要流向那些科技基础条件完善、科技力量雄厚和产业基础较好的经济发达地区,而经济不发达区域和少数民族及贫困地区由于基础较弱而很难得到财政科技投入支持。与此同时,我国科技研发持续投入战略尚不明朗,科技投入没有形成稳定增长机制,投入结构不尽合理,特别是对基础研究的投入明显不足,严重制约了我国原始创新能力的提升。第三,当前企业已成为我国科技活动的主体,近半数以上的科技人员来自企业；但我国科技人员主要分布在广东、江苏和北京、上海等东部发达地区；而在中西部欠发达地区,由于经济发展水平较低,企业创新意识淡薄,科技人员的工资待遇、科研环境和创新氛围较差,科技人力资源特别是高端科技人才十分缺乏。总体上,我国R&D人员的学历结构仍然偏低,高层次科技人才严重缺乏,已经成为当前制约我国企业提升自主创新能力的主要障碍。第四,从科技资源投入产出角度来看,基础研究的R&D人员投入、财政资金投入和企业资金投入对我国科技创新能力和产出绩效的影响显著；其中,特别是基础研究领域的R&D人员投入成为当前影响和制约我国科技创新能力与产出绩效的核心要素。应用研究领域的R&D人员投入、试验与发展研究领域的R&D人员投入及金融机构贷款对我国科技创新能力及产出绩效的影响相对较小。第五,1999-2007期间,随着科技人才队伍的不断壮大和科技投入的不断增加,我国科技资源配置效率和研发效率不断提高,这种提高主要源于技术进步加快和技术效率改善的双重作用,但技术效率改善的作用要大于技术进步加强的效果。同时,我国科技资源配置过程中仍然存在大量的重复投入和资源浪费,投入结构不尽合理,资源配置方式仍然以计划为主导,市场对科技资源的基础性配置作用难以充分发挥,科技资源配置效率仍有较大提升空间。基于研究,论文最后针对我国科技资源配置从八个方面提出了有针对性的政策建议。一是理顺管理体制,加强科技资源配置的统筹与协调,合理界定各涉科管理部门职能,强化中观层面科技资源配置主体的职能。二是以现代院所制度建设为中心继续深化科研机构改革,优化科研力量布局和结构调整,加快科研机构的整合与重组,进一步明确科技成果权益的分配及归属。三是加强科技立法和制度规范建设,提升科技资源配置工作的战略性、权威性和规范性。四是建立多元化经费投入机制,要在确保科技经费两个法定增长的基础上,优化科技经费投入结构,强化科技经费的监管,并妥善解决科技经费使用中的现实问题。五是实施人才战略工程,加强创新型人才队伍建设,以实施高层次人才战略为抓手加大对青年科技人才、重点科研人才和团队的支持与培养,支持企业培养和引进科技人才。六是以科技资源共建共享为核心,加强科技基础条件平台建设要健全和完善科技基础条件平台共享机制。七是建立以企业为主体,以产业发展为导向,产学研紧密结合的创新体系,为企业创新营造良好的环境。八是建立区域创新中心和创新联盟,推动中西部欠发达地区创新能力建设和科技成果转化。论文的主要创新点在于：一是对科技资源及其特点进行了深入研究,首次提出了科技资源流变性、衍生性、再生性、系统性和层次性的特点,为深化对科技资源配置及其流动规律提供了科学的理论基础；二是通过对现行科技管理体制和配置机制及相关政策进行系统梳理与评价,深入探讨了当前影响我国科技资源配置效率提升的制度阻碍和机制缺陷,从而使研究更具体、更有针对性；三是运用集中度指标和基尼系数,重点对我国科技财力资源和人力资源配置的总量、区域及部门特征等进行了分析；同时,结合多元回归模型和科技资源投入产出效率评价两阶段模型对我国科技资源配置的投入产出绩效和配置效率进行了不同层面的分析,这使研究的视角更加多维化,解剖更加全面,论证更加充分。