地方高等教育财政性经费短缺一直是影响我国高等教育发展的瓶颈。政府高等教育财政拨款体制运行不畅,缺乏一套完善、健全的地方高等教育财政补偿体系。从高等教育发展的客观规律以及国际经验来看,实施政府间财政转移支付是解决高等教育财政不均衡的重要手段和必然趋势。目前,我国政府对高等教育财政转移支付涉及较少,并且支付方式的单一和支付方法的缺陷使执行多年的中央对地方高等教育财政转移支付制度已显露弊端。因此,重新审视高等教育财政转移支付情况,改革并建立新的政府间高等教育财政转移支付体系势在必行。　　本研究主要运用文献研究法、比较研究法以及定量分析法,以财政分权和准公共产品理论作为理论依据,在客观分析和评价我国地方政府高等教育财政发展现状的基础上,综合多国经验,研究并构建以“因素法”代替“基数法”作为纵向、以地方政府间高等教育外溢性补偿作为横向的高等教育财政转移支付模式,最终构建“纵向为主、纵横交错”的政府间高等教育财政转移支付体系。　　本研究设计的基于因素法的高等教育财政纵向转移支付模型,在一定程度上克服了以“基数法”为方法的高等教育财政转移支付体系所产生的弊端,在因素的选取上可客观、规范,科学的衡量各地方高等教育的实际需求及财政支付能力,如此可提高了中央对地方财政转移资金的使用效率;此外,以基于外溢性补偿原则的高等教育财政横向转移支付为辅,对平衡地区间高等教育财政水平的差距起到了作用,有利于引导和调动地方政府投资高等教育的积极性。