T淋巴细胞是介导适应性细胞免疫应答的主要免疫细胞之一,并在适应性体液免疫应答中发挥着重要的辅助作用。目前通常都是依靠流式荧光分选技术、根据T淋巴细胞表面标记物、特异性转录因子等表型来对T淋巴细胞的亚型进行区分,这种简单的分类方式无法直接提供不同T细胞亚型之间的总体差异及亚型内部差异的信息。近年来单细胞转录组测序技术的快速发展为我们研究T淋巴细胞的分群提供了强有力的工具和手段。本课题首先重新分析了外周血单核细胞的单细胞转录组数据,发现T淋巴细胞在外周血单核细胞群体中独立成簇,但是T淋巴细胞内部并没有形成明显亚群。这说明T淋巴细胞与B细胞、NK细胞、单核细胞、树突状细胞等其它单核细胞在转录组上有明显区别,但是该数据尚不能体现T淋巴细胞内部亚型之间的差异。接着通过整合6类常见的T淋巴细胞亚型的单细胞转录组数据进行重聚类分析,我们鉴定了每种亚型间特异性表达的标记基因并重新定义了得到的细胞亚群,同时探究了各细胞亚群之间的关系及模拟它们可能的分化发育轨迹。结果表明,在对所有T淋巴细胞进行合并分析后,我们发现了CD4+T细胞与CD8+T细胞各自独立成簇,但两者之间无明显的界限;单独对CD4+T细胞进行聚类分析发现各CD4+T细胞亚型之间也无明显的分界,说明各CD4+T细胞亚型之间存在一定的连续性。通过更进一步的聚类分析,我们在CD4+T细胞中发现了一类罕见的高表达细胞毒性分子的CD4+T细胞亚群,并将之定义为“scCD4+CTL”。此外,我们在CD8+CTL样本中同样发现了一类少有报导的特殊细胞亚型,该类细胞表面同时表达T细胞的特异性受体和NK细胞的特异性受体,我们将它定义为“sc-CD8+NKT”。最后,谱系分析表明,T细胞不同亚型之间的区别并不是离散的,而是在表达谱上呈现一种连续的状态。利用单细胞转录组测序对T淋巴细胞的分类进行重新探究,对于重新认识T细胞亚型具有重要意义,同时可以帮助我们更加深入地理解人体适应性免疫应答的作用机制,对于正在发展中的免疫治疗也具有重要的借鉴意义。