商业银行是我国金融体系中的核心支柱,其健康发展对金融业的繁荣、经济的良好运行至关重要。现阶段是我国经济转型升级、金融业深化改革的关键时期,因此,商业银行的良好发展是必然要求。但当前,我国商业银行还存在着诸多问题,如利润增速缓慢、信用风险有所上升、资产质量不断下降、金融创新动力不足、缺乏核心竞争力等等,而这些问题归根结底都是商业银行经营管理效率低下所导致的,因此必须提升我国商业银行的效率,以推动经济健康、可持续发展。如何通过一个合理、科学的方法评价我国商业银行效率是问题的关键。鉴于此,本文以5家大型商业银行和12家股份制商业银行为研究对象,利用三阶段DEA方法对商业银行的效率进行实证分析,由于该方法能够剔除环境因素和随机误差因素的影响,因此可以测算出更贴合实际的效率值。实证结果表明,第一,规模无效率是导致我国商业银行整体效率低下的主要原因,第二,机构个数的增加不利于效率的改进,第三,效率受所有权属性的影响,金融机构整改之前国家对国有银行的政策导向对现如今的大型商业银行的影响依然存在。基于实证结果,本文从深化商业银行改革、合理控制规模扩张、提升金融创新能力、提高员工专业素养和加强风险控制能力五个方面提出了对策建议。