中国汉族人群冠心病的分子遗传学研究

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冠心病(CAD)与其重要并发症心肌梗塞(MI)是由遗传因素、环境因素或两者相互作用引起的一类复杂性多基因遗传疾病,号称全世界十大“疾病杀手”之一。在中国,CAD/MI的死亡率逐年上升,每年有超过70万人死于CAD/MI,严重威胁中国人民的健康。全基因组关联分析(GWAS)是目前研究复杂性遗传疾病主要的遗传学手段,有利于发现疾病的易感位点或致病基因,从遗传学上去认知并解释疾病的致病机理,给临床预防、诊断与治疗提供了有效的指导。GWAS策略已经发现了近50个CAD/MI易感位点,在CAD/MI遗传学研究方面取得了突破性进展,为解释CAD/MI遗传病理机制奠定了坚实的遗传学基础。然而,由于GWAS策略是基于SNP为遗传标记的群体统计学分析策略,它本身具有一定的局限性,GWAS得到的易感位点具有种群和地理区域的差异性,GWAS结果需要在不同的人群中进行验证,以确保结果的可靠性、真实性。本论文基于目前尚存争议性的CAD/MI易感SNP rs17465637,它位于染色体lq41区域MIA3基因内含子内,通过一系列实验论证SNP rs17465637确实是CAD/MI易感位点,最终消除争议达成一致的观点。首先准备了一个中国汉族人群的CAD/MI病例-对照群体,包括2503个CAD病人与2920个正常对照,CAD病人群体中又包含了698个MI病人,验证SNP rs17465637与CAD/MI是否关联。我们的统计分析结果显示SNPrs17465637与CAD/MI显著关联,其p=0.01,OR=1.11。然后本论文再汇总已经发表的有关SNP rs17465637与CAD/MI关联的所有数据进行Meta分析。Meta分析时,一方面以种族与区域差异性分为亚洲群体和欧洲群体,另一方面以CAD严重程度差别分为总CAD群体和仅仅具有MI症状的MI群体。Meta分析结果显示,不管在亚洲群体、欧洲群体还是总群体,SNP rs17465637与CAD/MI都非常显著关联,总CAD群体或MI群体中关联参数p<1.00×10-9。我们还探讨了SNP rs17465637与CAD/MI勺风险因素脂质和脂蛋白B(apoB)的关联性。结果发现SNP rs17465637与apoB浓度水平显著关联,其p=1.58×10-4,而且具有性别效应,此关联仅仅局限于男性群体。我们也发现了SNPrsl7465637与LDL-C、TC和]LDL-C浓度水平存在关联,其中与LDL-C、TC的关联具有性别效应,它们仅仅只在男性群体中关联。另外,为了阐明SNP rs17465637与基因表达水平的关系,我们首先通过eQTL数据库预测与SNP rs17465637关联的基因,然后在我们研究群体中进行验证,结果发现基因TGFB2mRNA表达水平与SNP rs17465637是关联的。对于TGFB2和SNP rs17465637本身所在的基因MIA3,我们查询了相关功能研究进展的文献,发现1q41区域内这两个基因与CAD/MI的病理基础动脉粥样硬化的关系非常密切。因此,在后续(GWAS研究中,TGFB2与MIA3是研究易感位点1q41区域的重点考察对象,它们是CAD/MI两个非常重要的候选易感基因。综上,本研究提供了充足遗传学证据论证了SNP rs17465637是CAD/MI的易感位点,排除以前尚存争议性的结果,达成一致观点。我们也发现了SNP rs17465637与apoB、LDL-C、TC和HDL-C的浓度水平存在关联,并从遗传学角度暗示了TGFB2与MIA3是CAD/MI重要的候选易感基因。
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