选择性RAF小分子抑制剂和RAF/HDAC双靶抑制剂的设计合成及抗肿瘤活性研究

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RAF激酶是RAS/RAF/MEK/ERK信号通路(MAPK)的成员,其蛋白异常活化是癌症发生发展的重要因素。其中最常见的改变是BRAF激酶的突变,约占人类肿瘤的6%。超过90%的BRAF突变都是600位缬氨酸(V)替换为谷氨酸(E),以BRAFV600E为靶点的个性化治疗研究已经取得突破性的进展,目前已经有两个选择性RAF抑制剂vemurafenib(威罗菲尼)和dabrafenib(达拉菲尼)被多个国家批准上市用于晚期转移性和不可切除的黑色素瘤的治疗。然而它们的副作用及耐药问题阻碍了进一步临床应用,亟需寻找新骨架或新机制的解决耐药的RAF抑制剂。在第一章中,我们结合计算机辅助药物设计,合成了二氟乙炔苯磺酰胺类选择性RAF抑制剂,并进行了广泛的结构改造,详细的构效关系研究,体外和体内抗肿瘤生物活性研究。化合物在低浓度下抑制BRAF激酶活性,选择性抑制携带600位氨基酸突变BRAF激酶的肿瘤细胞增殖,对携带野生型BRAF激酶的细胞株没有活性。新型RAF抑制剂对转移性黑色素瘤病人来源的原代肿瘤细胞系(NZM20,NZM07)也有良好的抑制活性。药代性质较好化合物1-2s在含有486个激酶的全激酶谱测试中显示出优异的选择性,并能剂量依赖性抑制COLO205嫁接瘤的生长,可以作为候选化合物进行进一步研究开发。  对上市RAF抑制剂耐药机制的详细研究表明,RAF抑制剂与其它激酶抑制剂的耐药机制不同,不是由单一机制主导的,而是由多条信号通路介导,多种不同蛋白的快速改变引起的结果。对癌症普遍使用的耐药机制研究表明,癌细胞能通过表观遗传学组蛋白乙酰化修饰的改变,引起基因表达谱的快速动态变化,对治疗产生适应性,引起耐药。我们推测,同时抑制HDAC(组蛋白去乙酰化酶)可以把癌细胞的表观遗传学性质锁定在某一特定的状态,在源头限制癌症的对RAF抑制剂的适应性,从而克服RAF抑制剂的耐药,延长病人对药物的响应时间。HDAC抑制剂还能通过改变非组蛋白的乙酰化状态,与RAF抑制剂产生协同抗肿瘤作用。在第二章中,我们以HDAC抑制剂SAHA和RAF抑制剂dabrafenib为起点,采用了药效团拼接的方法,设计合成了新型异羟肟酸脂类RAF/HDAC双重抑制剂并对化合物三个位点进行了详细的构效关系研究。结果显示linker部分的改造不影响BRAF激酶的抑制活性,当链长度为7个碳原子的饱和烷烃时,HDAC1和HDAC6的抑制活性最优。同时,我们对噻唑-2-位的取代基R1和磺酰胺取代基R2进行了结构的变换,活性相对较好的化合物2-7h对BRAF,HDAC1,HDAC6的IC50分别为3.5nM,40nM,20 nM,可以作为工具分子进行RAF和HDAC联合应用的生物机制研究。
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