辽宁绒山羊蛋白脂质蛋白质基因(PLP2)的表达研究

来源 :辽宁师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liqwart2
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辽宁绒山羊是我国特有的禁止基因外流的宝贵遗传资源,产绒量居全国第一。在前期工作中,我们通过建库及Primer walking质粒测通的方法克隆筛选出蛋白脂质蛋白质基因(proteolipid protein 2,PLP2)的全长序列。为了探究该基因的功能,我们对其进行了生物信息学分析(包括预测其开放阅读框,亲疏水性分析、跨膜预测分析、信号肽预测分析、磷酸化位点预测分析、二级结构预测、进化树的构建、多重序列的比对、保守结构域搜索),Real-time PCR,RT-PCR,原位杂交以及Noggin基因干扰慢病毒感染后目的基因的qPCR检测等的一系列分析研究。分析结果显示:首先,通过生物信息学分析,我们发现PLP2基因能够编码含有152个氨基酸的蛋白质,二级结构预测显示,PLP2基因含有α螺旋结构(46.05%)、延伸结构(12.5%)和无规卷曲结构(41.45%),功能位点分析显示,PLP2含有MARVEL结构域并且存在4个跨膜区,不存在信号肽,PLP2氨基酸含有3个Ser、2个Tyr和1个Thr可能成为蛋白激酶磷酸化位点;其次,通过RT-PCR检测显示,PLP2基因在皮肤、心脏、肝脏、肾脏、肺、脾脏中均有表达,且表达差异不是很明显,其中皮肤中的表达含量相对较高;同时,还运用了荧光定量PCR技术,定量的检测其在不同时期的表达情况,发现在兴盛期时,PLP2基因在次级毛囊的表达量约为初级毛囊的1.02倍(0.01<P<0.05),在退行期时,PLP2基因的表达量仍是次级毛囊高于初级毛囊,是初级毛囊的1.16倍(0.01<P<0.05);另外,经过原位杂交分析,发现PLP2基因在内根鞘有表达,而在外根鞘、毛干(角质层、皮层和髓层)以及毛囊乳突中无表达;最后,通过Noggin基因干扰后PLP2基因的qPCR检测,显示空白组的表达量是NC阴性对照的1.15倍,而noggin干扰后PLP2的表达量是NC阴性对照组的0.64倍。结论:(1)PLP2基因在皮肤、心脏、肝脏、肾脏、肺、脾脏各个组织中都有表达,这说明PLP2与各脏器相关功能无直接联系;(2)PLP2基因在兴盛期和退行期中的表达量均是次级毛囊高于初级毛囊,这说明PLP2基因对绒毛细度有一定的调节作用;(3)PLP2基因仅在内根鞘中有所表达,推测PLP2基因可能和绒毛脱落有关。(4)noggin基因干扰后,PLP2的表达量下降,这说明PLP2基因连同noggin基因等其他通路中的抑制基因一起,可能会对BMP通路有一定的影响,进而影响毛囊的发育。
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