2010年9月到2011年9月分四次对太子河流域的藻类植物群落组成进行了调查。共鉴定出藻类植物8门120属329种（包括21变种）。其中以硅藻最多，有36属144种，占总数的43.77％;其次是绿藻，有49属117种，占35.56％;其余蓝藻有22属39种，占11.85％;甲藻有4属6种，占1.82％;裸藻有3属11种，占3.34％;金藻有3属5种，占1.52％;黄藻有2属4种，占1.22％;隐藻最少，只有1属3种，占0.91％。底栖附着藻类28种，占总数的8.38％。在一年中，太子河流域藻类植物种数以夏季最多，有99属249种。2010年秋季藻类植物种类数有65属122种，而2011年秋季藻类植物种类数有46属76种。2010年秋季藻类植物种类数多于2011年秋季的原因是2010年夏季刚发过洪水，造成个别种类的藻类增长。春季藻类植物种类数有43属88种。　　太子河流域藻类植物总的细胞丰度在0.76×107cells·L-1～2.02×107 cells·L-1之间。细胞丰度在夏季时最高，平均细胞丰度为7.7×104 cells·L-1，秋季次之为3.9×104 cells·L-1，在春季时最低，为2.9×104 cells·L-1。　　太子河流域藻类植物的主要优势种有22种，其中蓝藻门4种，分别为巨颤藻（Oscillatoria princeps Vauch.）、小颤藻（Oscillatoria tenuis Ag.）、美丽颤藻（Oscillatoriaformosa Bory.）、螺旋鞘丝藻（Lyngbya contarta Lemm.）;绿藻门8种，分别为链丝藻(Hormidium flaccidum(Kütz.) Br.)、细链丝藻(Hormidium subtile(Kütz.) Heer.)、环丝藻(Ulothrixzonata(Web.Et Mohr) Kütz.）、池生毛枝藻(Stigeoclonium stagnatile(Haz.)Coll.)、偏生毛枝藻(Stigeoclonium subsecundum(Kütz.) Haz.)、普通水绵(Spirogyracommunis(Hass.) Kütz.）、美貌水绵（Spirogyra pulchrifigurata Jao）和维利微孢藻（Microspora willeana Lag.）;硅藻门9种，分别为偏肿桥弯藻（Cymbella ventricosaKütz.）、扁圆舟形藻(Naviculaplacentula(Ehr.) Grun.)、简单舟形藻（Navicula simplexKrassk.）、英吉利舟形藻（Navicula anglica Ralfs）、双头菱形藻(Nitzschia amphibianGrun.)、普通等片藻（Diatoma vulgare Bory）、变异直链藻（Melosira varians Ag.）、尺骨针杆藻(Synedra ulna(Nitzsch.) Ehrenb.)和窗格平板藻(Tabellaria fenestriata(Lyngby) Kütz.）;黄藻门1种，为小型黄丝藻(Tribonema minus(Will.)Haz.)。　　太子河流域藻类植物的Jaccard种类相似性指数范围在0.17-0.46之间，说明太子河流域藻类植物的季节更替明显。太子河流域藻类植物群落结构变化的主要影响因子是水温和营养盐。藻类植物多样性指数反映的水质状况较好，属于轻-中度污染状态。