萝藦科药用植物DNA条形码鉴定和分子系统学研究

来源 :北京协和医学院 | 被引量 : 0次 | 上传用户:stieyin
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萝藦科系热带植物区系的主要科,该科植物是我国重要的药用植物种质资源,在常用中药和少数民族民间用药中应用广泛。长期以来,萝藦科和夹竹桃科以及科下多个亚科和属之间分类界定存在争议,该类群形态上的复杂性以及民族地区用药中存在的同名异物、同物异名现象,导致萝藦科药用植物近缘物种间混用现象极其普遍,严重影响用药安全。萝藦科药用种质资源鉴定困难与其分类学复杂的现状密不可分,传统的鉴定方法很难对这些物种进行有效区分。基于此,本研究通过DNA条形码和分子系统发育研究,探讨了萝藦科药用植物类群的分子鉴定和分子系统关系,为该科植物的物种分类及药用混淆品种的鉴别提供了分子依据,对于保障中药临床用药安全具有一定的现实意义,同时也为该科植物开展更深入的系统分类和开发利用研究提供了科学参考。主要研究结果如下:1)研究了叶绿体片段(matK,psbA-trnH,rbcL)和核基因ITS2片段作为条形码对萝藦科药用植物类群的鉴别效率。结果表明:对四段条形码序列的鉴定效率进行比较,基于贝叶斯推论法(Bayesian inference,BI)和最大似然法(Maximum likelihood,ML)建树比使用临近距离法(Neighbor-Joining,NJ)法有更好的鉴定潜力。使用ITS+psbA-trnH条形码组合片段对本实验萝藦科样品的鉴定成功率约为82.2%。考虑到引物通用性、测序质量、物种鉴定效率和研究成本的综合因素,推荐ITS+psbA-trnH组合条码作为萝藦科药用植物鉴别的DNA条形码。2)基于叶绿体片段(matK,psbA-trnH,rbcL)和核基因ITS2片段对国产萝藦科类群的分子系统分类进行了研究,重建了国产萝藦科类群的分子系统树。根据近年来的分子研究成果,讨论了《中国植物志》的分类与APG系统不一致的类群,探讨了中国萝藦科类群存在的分类问题。
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