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地衣是由地衣共生菌和光合共生物组成的复合生物体,是全球生态系统的重要组成部分,而地衣内生真菌(endolichenic fungi)是一类广泛定植于地衣体内部的、不会对宿主地衣的结构造成任何可见损伤的真菌类群。地衣内生真菌具有丰富的物种多样性和潜在的经济价值。本论文以采自陕西太白山地区和内蒙古黄岗梁地区的茸褐梅衣(Melanelixia glabra)和采自黄岗梁地区的Melanohalea septentrionalis为材料,利用分离培养和高通量测序两种方法对不同地域褐梅衣类地衣内生真菌物种多样性进行了研究。经过分离培养,从150份茸褐梅衣地衣材料中分离得到内生真菌555株,内生真菌的定殖率为26.43%。高通量测序从共计30份地衣材料中获得优质序列608217条,其中内生真菌序列共计208814条,占全部序列的34.3%。比较表明,高通量测序技术在研究地衣内生真菌群落多样性方面具有传统分离培养方法无法比拟的巨大优势论文研究表明,1、地域因素和宿主种类都会显著影响地衣内生真菌群落。对于同科不同属的褐梅衣类地衣而言,地域因素对内生真菌群落的影响要高于宿主种类的影响。2、太白山茸褐梅衣内生真菌群落的物种丰富度和多样性均高于黄岗梁的茸褐梅衣。茸褐梅衣内生真菌群落的物种丰富度和多样性均高于Melaohalea septentrionalis。3、子囊菌门、座囊菌纲和格孢腔目真菌分别是各自分类阶元中的优势类群。三组地衣内生真菌群落中各分类水平上物种构成比例基本相同,但多数的物种丰度存在显著性差异。4、分离培养得到的茸褐梅衣内生真菌OTU数量仅为高通量测序得到的1/20。能够通过分离培养方法获得的茸褐梅衣高丰度内生真菌大多为已知种类,未能培养得到的高丰度内生真菌多为未知种类。5、部分内生真菌对其地衣宿主来说是无利的,甚至会影响地衣宿主的生长。论文首次比较了不同方法对褐梅衣类地衣内生真菌群落多样性研究的影响,总结出一套分析地衣内生真菌高通量测序数据的方法流程,系统的分析了不同地域褐梅衣类地衣内生真菌的多样性,阐明了影响褐梅衣类地衣内生真菌群落多样性的因素,并揭示了内生真菌和地衣宿主之间的关系。本论文丰富了人们对地衣内生真菌这一特殊的真菌类群的认识,为更好的开发和利用地衣内生真菌资源提供了理论依据。