农民资金互助合作社是我国农村金融改革中的新兴产物，一定程度上缓解了农民的资金需求与有效供给不足的矛盾，填补了正规金融机构在农村的空白，适应了农村金融改革的需要。中央和省也多次出台相关文件，鼓励积极稳妥发展农民之间的资金互助。2005年江苏省第一家农民资金互助合作社在盐城成立后该组织开始蓬勃发展，先后在全省10个市开展了试点工作，至2013年6月成立农民资金互助合作社409个。　　但农民资金互助社在试点的发展过程中存在机构法律定位模糊、变相吸收公众存款、资金投向超出“互助”范畴、风险控制薄弱、组织人员专业知识不足，外部监督管理力度不够、扰乱了农村金融市场的秩序等问题，严重制约了农民资金互助社的发展。为了改善这种环境，使农民资金互助社能够有效的可持续的发展，维护社员的基本利益，本文将以江苏省内的农民资金互助合作社为研究对象，找出运行机制中存在的问题，然后有针对地提出相应的对策建议，一定程度上为政府相关部门制定相关农民资金互助合作社资金互助的政策法规提供参考依据。　　本文通过查阅大量的相关文献资料，以合作经济和合作金融理论作为理论支撑，又从江苏省的实际出发，通过选取合作社进行一定的实地调查，以及从相关部门收集整理有效的数据，对农民资金互助合作社的现状、运行机制、存在的不足进行具体地剖析，并针对其不足提出相应的对策和建议。本文主要从农民资金互助合作社内部运作和外部支撑两个大的方向对存在问题进行分析。就机构内部存在变相吸收公众存款;资金投向超出规定范畴;风险控制薄弱;组织人员专业知识不足等问题进行剖析。同时也分析了外部法律定位模糊，监督管理力度不够和扰乱了农村金融市场的问题。根据以上提出的问题，通过案例的分析和实际调研提出一系列的建议:作为农民资金互助合作社自身要严格把控好资金的吸收和流向;加强内部管理，防范经营风险;强化相关人员的培训。从外部来看要明确行业定位，政府需加强和改善对农民资金互助合作社的监管，以及加强金融生态建设，为农民资金互助合作社发展提供良好的外部环境。