[研究背景]研究表明在基因或蛋白表达方面有一个或多个基因表达的变化与预后相关,并被用于乳腺痛的治疗。虽然许多有统计意义的相关性已经确定,但绝大多数还不足以很好地应用在临床上,因为这些基因当中许多和已知的一些生物学标志有关(如ER、HER2、Ki67),并且细胞或肿瘤的生物学行为是由许多基因协调表达的,这也使得我们不太可能由一个或几个基因的分析就能精确的预测已知肿瘤的临床行为。基于DNA芯片的全基因组表达分析被用于转录组研究,从而鉴定新的预后和预测因子,其中大量基于肿瘤基因表达谱评估的诊断报告已经商业化。基因表达谱分析使得在基因组水平下对所有基因表达水平的评估成为可能。肿瘤细胞行为取决于细胞生长调控相关基因的表达模式和细胞行为其它重要方面的相互协调。因此,全基因组表达谱分析有助于肿瘤行为的预测,包括发生远距离转移危险的预测和对特殊治疗反应的预测。[研究目的]尽管基底细胞样乳腺癌(basal-like breast cancer BLBC)有特定的形态、遗传及临床特征,但其生物学行为及临床疗效上仍然存在许多差异。许多BLBC子群由于不能被正确鉴定而导致不正确的诊断和/或不适宜的治疗。为了解基底细胞样乳腺癌基因表达谱,它与其他业型乳腺癌和正常乳腺组织中有明显差异表达的基因探索作为诊断基底细胞样乳腺癌的分子标志和治疗靶点的可能。[研究方法]总体样本来源于上海长海医院的84例乳腺浸润性导管性癌患者。患者都是进行了乳腺癌改良根治术和腋窝淋巴结清扫,平均年龄49岁,手术前未接受其他任何治疗。根据筛选要求选出48例,LuminalA/B (ER+, EP+, Her2/neu-), HER2+(ER-, EP-, Her2/neu+), basal-like (ER-, EP-, Her2/neu-, CK5+)挑选四种亚型各12例,同时在48例标本中选出6例距离肿瘤组织边缘至少5cm的癌旁组织作为对照组。通过包含48804个探针的人类mRNA基因表达谱芯片比较48例各亚乳腺癌和6例正常乳腺组织基因表达谱。并通过荧光实时定量PCR (RT-PCR)法进进结果验证。[研究结果]1.通过比较乳腺癌标本和正常乳腺上皮组织的基因表达谱,显示有99个基因明显上调超过四倍差异,43个基因下调超过5倍差异。具有最高FC值的明显上调和下调的基因,KLK5, ART3, FNDC1, CALB2等。虽然每个基因的定量变化在RT-PCR和基因芯片分析中不是完全相关的,但是这两种检测中基因上调和下调的趋势是一致的。它们具有不同的生物学分类。超过30%的基因编码合成功能不明确的蛋白或不编码合成任何蛋白。其他的70%基因通过GO分析编码多种生物功能的蛋白,其功能与细胞粘附、细胞凋亡、细胞增殖和分化相关。为了从基因表达分析中获得上诉结果的证实,我们选择了36个上调和下调明显的有统计学意义的基因做荧光定量RT-PCR检测：IGJ, HBB, MUCL1, HBA2, SLPI, DCD, EEF1A2, BAG4, AGR3, ESM1, TNNT1, AGR3, PIGR, HBA2, CPB1, CGA, ASF1A, MSLN, TIGA1, FABP4, S100A7, CEL, DLK1, PNMT, PIP, TFF3, PTCHD1, MLPH, CITED4, FXA1,TNMD,RDH10, KLK5, ART3, FNDC1, CALB202.在上调基因中研究分析发现基因KLK5在BLBC中是显著上调的,但KLK5基因在Luminal A、LuminalB、HER2过表达的乳腺癌组织与正常乳腺上皮细胞的基因表达谱中下调超过两倍。通过研究基因表达谱显示与正常乳腺组织相比,KLK5在LuminalA/B的亚型中、和HER2过表达亚型中低表达,而在BLBC中呈高表达,后通过RT-PCR检测中得到进一步验证这一结果。本研究采用的网络信号传导分析较好地解释了KLK5的调控机理。研究分析表明KLK5可能与BLBC的形成、发展、侵袭转移密切相关,很可能成为BLBC一个的新的预测标志和治疗靶点。但仍需要进一步实验研究其在BLBC生物过程调控作用机理。[研究讨论]分析比较各亚型乳腺癌基因之间的差异从中找出在BLBC未报道过的差异表达明显的基因KLK5。我们认为这个基因可以作为诊断基底细胞样乳腺癌的标志基因和治疗靶点。同时通过深入研究由KLK5基因参与调控的磷酸化信号网络关系将可能为研发BLBC的特异性诊断标志物和靶向治疗提供新的思路及理论基础。