【摘 要】
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目的:应用生物信息学方法分析纤维蛋白原样蛋白2(Fibrinogen-like Protein 2,FGL2)与胶质瘤的关系,探讨FGL2在胶质瘤中的潜在预后价值和免疫治疗的靶向性。方法:使用TCGA、GETx和GEO数据库分析FGL2在胶质瘤组织中的转录水平,通过TCGA数据库中低级别胶质瘤和胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)患者的临床资料,分析FGL2的表达与临床病理特征的关系。
【基金项目】
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山西省留学回国人员科技活动择优资助项目“垂体瘤质地术前多因素综合评估临床与实验(编号:2008-56)”;
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目的:应用生物信息学方法分析纤维蛋白原样蛋白2(Fibrinogen-like Protein 2,FGL2)与胶质瘤的关系,探讨FGL2在胶质瘤中的潜在预后价值和免疫治疗的靶向性。方法:使用TCGA、GETx和GEO数据库分析FGL2在胶质瘤组织中的转录水平,通过TCGA数据库中低级别胶质瘤和胶质母细胞瘤(Glioblastoma,GBM)患者的临床资料,分析FGL2的表达与临床病理特征的关系。生存分析采用Kaplan-Meier生存分析、单因素和多因素Cox回归分析。基因集富集分析(Gene set enrichment analysis,GSEA)筛选FGL2的信号转导通路。此外,我们使用已建立的算法CIBERSORT来比较FGL2不同表达水平样本之间的免疫细胞的差异和评价22种免疫细胞在各个样本中的比例差异。采用基因集变异分析(Gene set variation analysis,GSVA)和相关性分析探讨FGL2、浸润的炎性免疫细胞和免疫检查点分子之间的关系。结果:FGL2在胶质瘤呈高表达,FGL2的高表达与预后不良和临床病理特征进展有关。GSEA表明,FGL2的高表型与一些免疫相关途径有关。GSVA和相关性分析发现FGL2的表达与炎症反应和免疫反应密切相关,免疫细胞浸润程度较高。结论:FGL2可能是胶质瘤的一个潜在的预后生物标志物和免疫治疗的靶点。
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