【摘 要】
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目的:未分化甲状腺癌（anaplastic thyroid carcinoma,ATC）作为一种高死亡率甲状腺癌特殊亚型,属于侵袭性最强的肿瘤之一。研究表明,复杂的基因相互作用会影响ATC肿瘤的发生和预后。因此,本研究旨在寻找与ATC发病相关的潜在关键基因。方法:下载GEO数据库中的GSE33630和GSE65144表达谱芯片并筛选差异表达基因（DEGs）,进一步构建蛋白质·蛋白质相互作用网络（P
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目的:未分化甲状腺癌（anaplastic thyroid carcinoma,ATC）作为一种高死亡率甲状腺癌特殊亚型,属于侵袭性最强的肿瘤之一。研究表明,复杂的基因相互作用会影响ATC肿瘤的发生和预后。因此,本研究旨在寻找与ATC发病相关的潜在关键基因。方法:下载GEO数据库中的GSE33630和GSE65144表达谱芯片并筛选差异表达基因（DEGs）,进一步构建蛋白质·蛋白质相互作用网络（PPI）和加权基因共表达网络（WGCNA）,来确定与ATC发生显著相关的关键hub基因和通路。并对DEGs进行GO和KEGG富集分析。最后利用TCGA-THCA数据和GSE53072表达谱芯片验证hub基因。结果:通过表达谱芯片筛选到1063个差异表达基因。进一步功能和途径富集分析发现,上调的DEGs在细胞外基质组织、细胞外结构组织、核分裂和细胞器分裂等方面均明显富集;下调的DEGs在甲状腺激素代谢过程,甲状腺激素生成和细胞修饰氨基酸代谢过程中显著富集。通过PPI网络鉴定出10个关键基因（CXCL8、CDH1、AURKA、CCNA2、FN1、CDK1、ITGAM、CDC20、MMP9 和 KIF11）,这些基因可能与肿瘤的发生发展密切相关。在共表达网络鉴定出的4个ATC相关模块与PI3K/Akt信号通路、p53信号通路、Hippo信号通路和ECM受体的相互作用密切有关。在TCGA和GSE53072公共数据表明这些hub基因可成为ATC发生发展潜在的生物标记物。结论:综上所述,通过基于生物信息学分析鉴定出hub基因和与ATC发生发展相关的信号通路,这些hub基因有望成为ATC诊断和治疗潜在靶点。
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