21世纪是知识经济的时代，科学技术是第一生产力越来越得到社会经济发展的验证。科学技术是推动整个经济社会向前发展的原动力，科技资源作为区域经济发展的动力源，是知识经济时代的第一资源。随着经济全球化程度的进一步提高，各国综合国力的竞争越来越多地体现为创新能力的竞争。科技资源作为国家最重要的战略资源，其投入的数量与质量是一个国家创新能力的重要基础，从根本上决定着这个国家的创新水平和创新绩效。因此，科技资源配置水平的高低直接关系着区域经济发展的动力和方向。在此背景下，研究河南省科技资源的优化配置对于我省科技资源的科学合理利用，加快中原经济区建设和实施可持续发展战略均有重要的理论意义和实用价值。本文在认真研究国内外文献的基础上，首先对科技资源优化配置的相关理论进行了系统地介绍，包括科技资源的涵义、科技资源的特点、科技资源配置的内容以及科技资源配置系统；其次，从科技资源投入和产出角度分析了河南省科技资源配置的现状并且构建了河南省科技资源配置的评价模型；再次，在构建的评价模型的基础上运用DEA-Malmquist模型对河南省科技资源的配置情况进行横向和超效率DEA模型纵向两个层面的分析和评价。最后，通过对模型分析结果的研究和评价，提出了河南省科技资源优化配置的对策。