随着沿岸水域富营养化的加剧,世界许多河口都存在季节性低氧的现象。自上世纪六十年代以来,低氧区的数量大约每十年翻番,并且低氧区的范围、持续时间、强度都有明显上升的趋势。河口生物种类繁多,根据它们的运动能力和栖息环境的不同可分为浮游生物、游泳生物和底栖生物。河口低氧不仅影响各个生物类群的分布与生存,而且还会改变生物群落结构、影响生态系统的结构与功能。因此,河口低氧引起的生态效应受到人们越来越多的关注。2006年7月1日至8月30日在长江口及其邻近水域进行了一个多学科的综合海洋调查航次。发现在长江口外(31°N-32°N,122°15’E-123°15’E)存在一个中度底层低氧区(溶解氧浓度<3mg L-1的低氧区面积约为6800km2)。本文根据本航次获得的调查资料,对形成季节性底层低氧的环境特征及低氧对大型底栖动物的影响进行了较系统分析。结果表明：低氧区大型底栖动物总丰度、环节动物和软体动物丰度高于非低氧区；环节动物和软体动物等耐低氧生物趋向分布于低氧区,并且他们与底层溶解氧有非常显著的负相关关系；根据多元尺度分析可以把大型底栖动物划分为两组类群,其中一类群属于低氧类群,主要由多毛类环节动物组成。总之,2006夏季长江口的低氧是中度低氧(溶解氧均大于2mg/L),对底层生态系统还没有产生严重的影响,但在低氧区大型底栖生物类群组成发生了明显的变化,形成了以环节动物和软体动物等耐低氧类群为主的大型底栖生物群落。