南四湖是南水北调东线干线的重要调蓄湖泊,也是山东省重要的工业、农业与生活用水水源地,其水质状况不仅关系到南四湖区域的可持续发展,还直接影响着南水北调东线输水水质安全。当前,湖泊富营养化问题已成为我国各大湖泊面临的主要环境问题,而藻类过度疯长及其引起的藻类“水华”则是影响湖泊供水安全的重要隐患。因此,分析南水北调东线藻类生长的影响因子,评价南四湖的生态系统健康,对南水北调东线工程的顺利实施,降低东线的调水水质风险,保障受水区的水质安全促进南水北调沿线社会经济良性发展具有重要的现实意义和指导价值。本文利用spss13.0软件,以水温、总氮、总磷、pH值、CODMn、浊度、透明度和DO等因子为自变量,以叶绿素a和藻类密度为因变量,重点分析了南四湖的主要环境因子与叶绿素a、藻类密度之间的相关关系,深入分析了主要环境因子对南四湖绿藻、蓝藻和硅藻等主要浮游藻类生长的影响。同时,本文对南四湖的生态系统健康状态进行了评价,首先,本文在选取评价指标时充分考虑了南四湖的实际情况以及数据获取情况,重点从环境要素指标、结构指标和系统指标三个方面(10个分指标)选择评价指标,构建出南四湖生态系统健康评价指标体系；其次,确定南四湖生态系统健康的评价标准,将南四湖的健康状况划分为五个等级；再次,通过墒权平均法计算南四湖各指标的权重；最后,运用模糊综合评价法得出南四湖的生态系统健康状态。评价结果为：南四湖生态系统健康级别为一般,五个监测点的生态系统健康级别分别为：前白口为疾病状态,二级坝为病态,南阳的健康状态最佳,为很健康状态,大捐和岛东的健康状态为一般。