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病害的频繁发生给凡纳滨对虾养殖业带来巨大的损失。白斑综合症病毒(whitespotsyndromeviruse，WSSV)是目前全球对虾养殖业面临最严峻的挑战之一，凡纳滨对虾是WSSV感染的主要宿主，对虾在感染WSSV3～10天内累积死亡率可达80％-100％。因此，选育抗WSSV的凡纳滨对虾品系来预防白斑综合症(WSS)的流行传播是迫切之需。
本文对抗WSSV凡纳滨对虾进行了选育，并应用RAPD及AFLP方法对F1代遗传多态性及抗WSSV性状与对WSSV敏感性状相关的分子标记做了初步分析。结果如下：
在个体筛选实验中，1361条凡纳滨对虾进行了WSSV感染实验，死亡1052尾，存活309尾，死亡率为70.5％，其中雌雄虾的平均死亡比率为1.3：1，雌虾的死亡率高于雄虾；在家系选育实验中，对17个F1代家系连续进行两次WSSV感染实验，第一次感染实验WSSV液浓度为10-4，第二次感染浓度为10-3。通过对两次感染实验的17个家系存活率比较，得到家系203为抗病家系，家系209为敏感家系，且注射感染剂量的多少与死亡率成正比关系。
在遗传多态性分析中，根据遗传相似性系数、采用UPGMA法对17个家系进行聚类分析，结果均形成3个姐妹群。虽然两种方法得到的每个群家系组成不是很一致，但在总体上均与是否具有抗病性而存在一定的相关性。
应用RAPD对抗WSSV性状及对WSSV敏感性状相关分子标记进行分析，得到与203家系抗病相关的分子标记3个，与209家系对WSSV敏感相关的分子标记1个，209家系特征分子标记1个；而应用AFLP技术得到与抗病相关的分子标记264个，与WSSV敏感相关的分子标记9个，203家系特征分子标记37个，209家系特征分子标记9个。