【摘 要】
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目的:采用LNATMmicroRNA芯片技术,探讨去甲基化剂5-氮杂脱氧胞苷酸对胰腺癌BxPc-3细胞中microRNAs表达的影响,并获得DNA甲基化修饰的microRNA表达谱。方法:将胰腺癌BxPc-3细胞的
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目的:采用LNATMmicroRNA芯片技术,探讨去甲基化剂5-氮杂脱氧胞苷酸对胰腺癌BxPc-3细胞中microRNAs表达的影响,并获得DNA甲基化修饰的microRNA表达谱。方法:将胰腺癌BxPc-3细胞的培养及分实验组和对照组,实验组给予5-氮杂脱氧胞苷酸,处理72hr,对照组给予同体积的PBS。再把裂解好的组织有机抽提,过滤分离RNA,然后用电泳检查芯片RNA的完整性并用紫外分光光度测定RNA浓度和纯度。设定miRNA微陈列探针及荧光标记miRNA (cy3/cy5),经过杂交和洗脱后,进行microRNA芯片检测,采集扫描图像和处理数据。然后再用Trizol法提取总RNA,并用1%琼脂糖电泳验证其完整性。最后根据芯片结果,选择3个表达异常的miRNA进行RT-PCR,进一步验证miRNA的异常表达结果的可靠性。结果:1、依芯片结果,以RATIO>2倍为上调和RATIO<0.5倍为下调的标准,获得miRNA差异表达谱。分析得出,共有63种miRNA上调和21种miRNA下调。其中上调明显的有6种miRNA(miR-605、miR-720、miR-197-4、miR-34b、miR-148a和miR-205),下调明显的有3种miRNA(miR-569、miR-1207-5p和miR-1268)。2、从表达明显异常的9种miRNA中选择3种(miR-34b、miR-148a和miR-205)进行RT-PCR验证发现3种miRNA相对于对照组表达明显异常,与芯片结果变化趋势一致。结论:通过分别对胰腺癌BxPc-3细胞去甲基化处理组和未处理组进行miRNA芯片分析和RT-PCR验证,部分miRNA在胰腺癌中由于过甲基化而导致异常表达,并筛选出去甲基化后的miRNA表达谱。证明了DNA甲基化对miRNA异常表达的重要影响,以及miRNA在胰腺癌中的诊疗意义。
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