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目的：运用微阵列对膀胱尿路上皮癌中差异表达的长链非编码RNA基因进行筛选并验证筛选结果。方法：首先征得所有受试者本人或其直系亲属同意,并取得医院医学伦理委员会同意,留取2010年3月~2011年3月间在我院行膀胱肿瘤电切、膀胱部分切除术或根治性膀胱切除术的病人,共留取可用肿瘤标本35例,经病理诊断均为膀胱尿路上皮癌,正常膀胱粘膜组织10例。选取其中女性2例,男性13例,年龄35~78岁(平均61岁),12例尿路上皮癌标本及3例正常人膀胱尿路上皮粘膜,提取RNA,逆转录成cDNA并标记,在标准条件下将标记好的与微阵列进行杂交,使用荧光扫描仪扫描荧光强度并分析基因表达谱差异。使用配套软件对原始数据进行标准化处理,计算出每个基因的Fold change值,取Fold change>=2.0倍,t检验值<=0.5作为阳性结果。之后行实时定量PCR实验对筛选部分结果进行验证,使用管家基因GAPDH作为内参,以样品待测基因的值除以此样品内参的值,最终得到的比值为样品的待测基因相对含量。计算所有实验组平均待测基因相对含量除以对照组平均待测基因相对含量得出实验组和对照组待测基因差异。结果：使用微阵列技术对膀胱尿路上皮癌异常表达的LncRNA进行了初步筛选,通过Rinn lincRNAs profiling方法共发现了25条异常表达的LncRNA,其中lincRNA-TSPAN8、AC079305.6、lincRNA-BBOX1-2三条因在肿瘤组织中表达下调,lincRNA-SLC39A10-1、lincRNA-LM01-2、BC039493、AL355916.1、 lincRNA-NFE2L3-3、AX746599、lincRNA-SNAI2-1、lincRNA-LOC285733-1、 lincRNA-DACT2-3、lincRNA-RPUSD4-2、 AC004987.7、lincRNA-MEF2A、 lincRNA-ALX1-1、lincRNA-LOC100500938-1、lincRNA-KLRB1、BDNFOS、 lincRNA-STK35、RP11-572M11.2、lincRNA-PRSS16、RP11-315H15.1、 lincRNA-LOXLl-2均在肿瘤组织中表达上调。通过Enhancer LncRNAs profiling方法共发现了7条异常表达的LncRNAs:BC039493、RP11-102N11.1、BC041451、 AF127936.3、RP11-552E20.1、AC068610.3、RP11-315H15.1,均为肿瘤组织相对正常组织高表达基因。我们进一步从两种筛选方法命中基因中选取信号差异最大的lincRNA-PRSS16和2种方法均命中的2条基因(RP11-315H15.1与BC039493)进行Realtime PCR检测,最终结果显示验证的3种基因在肿瘤组织中确实存在不同程度的高表达：lincRNA-RPSS16肿瘤/正常=11.5887；BC039493肿瘤/正常=2.4924; RP11-315H15.1肿瘤/正常=5.5211。所有异常表达基因中AC079305.6则在NMIBC组织中表达下调,MIBC组织中表达无异常,lincRNA-LOC285733-1和AC068610.3则在NMIBC组织中表达上调、MIBC组织中表达无异常。结论：正常膀胱尿路上皮和膀胱尿路上皮癌之间存在差异表达长链非编码RNA,通过Rinn lincRNA profiling方法发现了25条异常表达LncRNA;通过Enhancer LncRNA profiling方法共发现了7条异常表达的LncRNA,这些基因可能作为新的肿瘤标志物或肿瘤治疗靶点。选取结果中最有可能成为癌标的3条LncRNA进行RT-PCR实验,PCR结果与微阵列筛查结果吻合。在浸润性膀胱尿路上皮癌和非浸润性膀胱尿路上皮癌对比中,有三种LncRNA存在异常表达并可能与肿瘤恶变有关。