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肥厚型心肌病(hypertrophic cardiomyopathy,HCM)是一种以心肌非对称性肥厚且不伴有心室(一般为左心室)内腔扩大为特征的家族性心脏疾病,严重患者可能并发室性心律失常、房颤、心力衰竭及心源性猝死等,但其致病机制不详。因此,揭示HCM的致病机制,识别其重要生物标志物,对其诊断和治疗具有重要的科学与临床意义。随着分子生物学理论和技术的发展,国内外对HCM致病的分子机制研究有了较大的进展并取得了一定成果,但是研究的分子相对单一和局限,没能从分子间相互作用的网络层次去系统地研究其致病机制,已识别的重要生物标志物也比较有限。因此本文采用图论、复杂网络理论以及生物信息学的方法和手段,构建HCM相关的miRNA-mRNA-lncRNA三元混合网络;通过分析网络的拓扑特征和参数,识别HCM的重要标志物并分析其生物功能。本文的研究主要内容如下: (1)构建HCM相关的miRNA-mRNA-lncRNA混合网络。首先整理HCM的lncRNA、mRNA和miRNA表达谱数据,包括去除空值和重复值等;然后,用T检验加倍数法筛选出显著差异表达的lncRNA、mRNA和miRNA;接着,设计lncRNA、mRNA和miRNA三元混合网络构建方法,用差异表达的lncRNA、mRNA和miRNA构建HCM的miRNA-mRNA-lncRNA混合网络。最后,采用复杂网络理论验证该混合网络的生物属性。 (2)基于miRNA-mRNA-lncRNA混合网络特征,筛选HCM相关的重要标志物。根据节点的中心性测度介数、度以及紧密度排序,分别筛选网络的重要节点,获得HCM相关的重要lncRNA、mRNA和miRNA。 (3)采用GO、KEGG和GeneCards等生物信息学工具并结合相关工作,分析HCM相关的重要lncRNA、mRNA和miRNA的功能,解释HCM致病的分子机制。